Nachdem die Avengers in „Avengers: Endgame“ durch eine Zeitreise versehentlich einen alternativen Zeitstrang erzeugt haben, greift sich die Loki-Variante von 2012 den Tesserakt und teleportiert sich damit fort. Sie landet in der Wüste Gobi in der Mongolei, wo sofort Truppen der Time Variance Authority (TVA) aus Portalen treten. Sie brandmarken Loki als „Variante“ und wollen ihn wegen „Verbrechen gegen die heilige Zeitlinie“ festnehmen. Loki versucht sich freizukämpfen, doch Hunter B-15 verlangsamt mit einem Time Twister seinen Zeitfluss; anschließend wird der Zweig mit einer Ladung zurückgesetzt und Loki abgeführt.
In der TVA-Zentrale, in der seine Magie nicht funktioniert, wird Loki der asgardische Rüstung entkleidet und durchläuft die Aufnahme. Ein Einführungsvideo der Maskottchen-Figur Miss Minutes erklärt ihm die Ordnung: Nach einem Krieg zwischen den Zeitlinien hätten die Time-Keepers eine einzige „heilige Zeitlinie“ geschaffen und die TVA gegründet, um jede Abweichung aufzuspüren und abzweigende Stränge samt der sie auslösenden Varianten zurückzusetzen.
Vor Gericht macht Loki die Avengers für die Zeitabweichung verantwortlich, doch Richterin Ravonna Renslayer weist das zurück: Das Handeln der Avengers habe der heiligen Zeitlinie entsprochen, seine Flucht nicht. Sie befindet ihn für schuldig und verurteilt ihn zur Löschung. In diesem Moment greift der Agent Mobius M. Mobius ein, der glaubt, diese Loki-Variante könne der TVA von Nutzen sein.
Im Zeittheater konfrontiert Mobius ihn mit Ausschnitten aus dem Leben des ursprünglichen Loki und hält ihm seinen Überlegenheitsdrang vor. Er zeigt ihm, dass Loki im vorgesehenen Zeitverlauf mittelbar den Tod seiner Ziehmutter Frigga verschuldet. Loki nutzt eine Gelegenheit zur Flucht, stößt dabei jedoch auf ein umfangreiches Lager ruhender Infinity-Steine, die in der TVA wirkungslos sind – ein Beleg für die überwältigende Macht der Behörde.
Zurück im Zeittheater sieht Loki den Rest seiner vorgezeichneten Zukunft: die Aussöhnung mit seinem Bruder Thor, den Tod seines Ziehvaters Odin und schließlich seinen eigenen Tod durch Thanos. Erschüttert gesteht er Mobius, dass er keine Freude daran habe, anderen wehzutun, sondern nur seine eigene Schwäche verberge. Mobius gewinnt ihn daraufhin als Helfer bei der Jagd auf eine abtrünnige Loki-Variante, die Minutemen der TVA getötet und deren Rücksetz-Technik gestohlen hat.
