Als die Erde aus der Realität zu kippen droht, wird der Doktor im letzten Moment von Anita Benn gerettet, die inzwischen das Time Hotel leitet. Von ihr erfährt er, dass die Rani die Welt in einer Zeitschleife gefangen hält: Der 23. Mai wiederholt sich endlos, gespeist aus einem Wunsch von Conrad Clark und der Macht des Wunschwesens Desiderium. Über die Türen des Time Hotels stellt der Doktor die Erinnerungen seiner Begleiterin Belinda Chandra sowie des gesamten UNIT-Teams wieder her; Ruby Sunday und weitere Agenten werden per implantiertem Chip aus der Scheinwelt geholt.
Die Rani und Mrs Flood – zwei Inkarnationen derselben Time Lady – offenbaren ihren Plan: Sie wollen Omega, den ersten Time Lord, zurück ins Universum holen und ihn als Genquelle für ein neues, ihnen ergebenes Volk von Time Lords missbrauchen. Damit Poppy – die in der veränderten Realität geborene Tochter des Doktors und Belindas – bei der Rückkehr zur Normalität nicht ausgelöscht wird, lässt der Doktor Mutter und Kind tief unter dem UNIT-Turm in einem eigens gebauten Zero Room einschließen.
Im Bone Palace wird Omega heraufbeschworen – nicht als Retter, sondern als monströses, skelettartiges Wesen, das alles zu verschlingen droht. Omega frisst die Rani; Mrs Flood entkommt mit einem Time Ring. Mit dem Vindicator zwingt der Doktor Omega zurück in seine Gefangenschaft. Ruby gelangt an Bord und stellt sich dem bewaffneten Conrad: Sie wünscht sich, dass Conrad in einem neuen Leben glücklich wird und dass sein ursprünglicher Wunsch aufgehoben wird. So endet die verzerrte Realität.
Die Welt wird wiederhergestellt, mit kleinen Abweichungen. Doch als der Doktor und Belinda mit Poppy aufbrechen wollen, verschwindet das Kind – nur Ruby erinnert sich an sie. Ruby überzeugt den Doktor, dass Poppys Auslöschung ein Fehler ist. Um sie zurückzuholen, setzt der Doktor – kurz unterstützt von seiner dreizehnten Inkarnation – eine Regeneration in Gang und nutzt deren Energie, um die Zeitlinie leicht zu verschieben: In der neuen Version existiert Poppy als Belindas Tochter. Nach dem Abschied vollendet der Doktor seine Regeneration im Licht des Sterns von Joy und nimmt eine neue Gestalt an, die seiner früheren Begleiterin Rose Tyler gleicht.