Das Serienfinale spielt in der paradiesischen Welt der Mulefa, in die Lyra und Will geflohen sind. Lyra trauert — sie glaubt, ihre Mutter Mrs. Coulter sei tot, und ahnt, dass auch Lord Asriel nicht mehr lebt. Ihre Daemonen halten sich noch fern. Unbemerkt betritt Pater Gomez die Welt, fest entschlossen, die „neue Eva“ Lyra zu töten.
Das Alethiometer führt die beiden zu den Mulefa; Atal geleitet sie zu Mary Malone. Durch eine Bernsteinlinse zeigt Mary ihnen, dass der Staub — von den Mulefa „Sraf“ genannt — keine Sünde ist, sondern das Bewusstsein selbst. Doch der Staub strömt aus der Welt, und die Bäume sterben. Nur ein Akt der Kreativität oder eine große Entdeckung könne ihn zurückholen.
Am Abend erzählt Mary, wie sie als Nonne bei einer Konferenz in Lissabon die Liebe für sich entdeckte und daraufhin das Kloster verließ. Ihre Geschichte lässt Will und Lyra ihre eigenen Gefühle erkennen. Als Gomez schließlich auf Lyra anlegt, tritt ihm der Engel Balthamos entgegen, zerdrückt dessen Daemon und tötet den Priester, ehe er selbst vergeht.
Am Wasser küssen sich Lyra und Will — und der Staub flutet zurück in die Welt: Die Prophezeiung erfüllt sich, ein grünes Polarlicht zieht über alle Welten. Die getrennten Daemonen kehren zurück; Pan legt sich als Baummarder fest, und Serafina gibt Wills Daemon den Namen Kirjava.
Xaphania eröffnet Mary, dass ihre Erzählung die Heilung des Multiversums auslöste — doch der Staub versickert seit Jahrhunderten durch die mit dem Zauberigen Messer geschnittenen Fenster. Alle Fenster müssen geschlossen werden; nur das aus der Totenwelt darf bleiben. Will muss in seine Welt zurückkehren und das Messer zerbrechen, damit die Engel die Übergänge versiegeln können.
Weil Daemonen in einer fremden Welt nicht lange überleben, müssen Lyra und Will für immer getrennt in ihren Welten leben. Schweren Herzens nehmen sie Abschied und schwören, sich nach dem Tod wieder zu vereinen. Sie vereinbaren, sich fortan jedes Jahr zur Sommersonnenwende auf einer Bank im Botanischen Garten „zu treffen“. Will wird später Arzt, Lyra lernt in Oxford erneut, das Alethiometer zu lesen.
