Bishop und Forge müssen feststellen, dass der Großteil der X-Men über die Zeit verstreut wurde – die einen im Ägypten des Jahres 3000 v. Chr. (Xavier, Magneto, Beast, Nightcrawler und Rogue), die anderen im 40. Jahrhundert des Jahres 3960 (Cyclops, Jean Grey, Storm, Morph und Wolverine). Gemeinsam bauen Bishop und Forge eine Zeitmaschine: Bishop reist in die Vergangenheit, Forge in die Zukunft zu seiner Liebe Storm.
In 3960 gerät Forge sofort in die Gewalt von Apocalypse' Kampfrobotern, wird jedoch von Storm und Wolverine gerettet – Letzterer kämpft in dieser Zukunft mit Knochenkrallen statt seines gewohnten Adamantium-Skeletts. Zusammen mit Jean Grey und Cyclops trifft die Gruppe auch auf den jugendlichen Nathan, den Sohn von Scott und Jean, der einst in die Zukunft geschickt wurde, um zu überleben, und dazu bestimmt ist, als Cable Apocalypse aufzuhalten. Cyclops und Jean offenbaren Nathan bei dieser Gelegenheit, dass sie seine Eltern sind.
Storm gelingt es mit Hilfe von Mother Askani, Apocalypse' Horsemen aufzuhalten. Askani offenbart dabei, dass sie es war, die das Team über die Zeit verteilt hat, um Apocalypse gleichzeitig in Vergangenheit und Zukunft zu bekämpfen. Nachdem seine Pläne im 40. Jahrhundert scheitern, beschließt Apocalypse, die X-Men stattdessen dort zu treffen, wo sie am verwundbarsten sind: in den 1990er-Jahren.
