Im Staffelfinale schließen sich X-Force und X-Factor zusammen, um Gambit auszuschalten – in dessen Körper Apocalypse gefangen ist. Während Rogue, Nightcrawler und Beast zu Apocalypse' Schiff aufbrechen, um einen Weg zu finden, Gambit ohne Tötung zu retten, verteidigen die übrigen X-Men den belagerten X-Corp-Turm gegen die beiden abtrünnigen Teams und von der O.N.E. gesteuerte Sentinels.
In einer Reihe von Duellen treffen Wolverine und Morph auf Archangel und Psylocke, Jubilee und Havok liefern sich ein Luftgefecht, und Cable stellt sich seinen Eltern Cyclops und Jean Grey. Cable kämpft sich zu Gambit durch, doch als er ihm in den Kopf schießt, setzt das nur Apocalypse frei, der in Gambits Körper eine neue Gestalt annimmt und die Anwesenden in seinen Bann zwingt.
Da trifft Rogue ein: Sie hat der Celestial-Entität Eson dem Sucher ihr Leben angeboten und dafür eine gewaltige Kraftsteigerung erhalten. Damit zieht sie Apocalypse aus Gambit heraus und sperrt ihn in eine Brosche. Rogue rechnet damit, mit ihrer neuen Macht zu vergehen – doch sie überlebt: Nightcrawler hat nach ihr einen eigenen Handel geschlossen und sein Leben für ihres eingetauscht.
In einem bewegenden Monolog spricht Nightcrawler von Hoffnung und Glauben, während die X-Men den Verlust verarbeiten. In der Post-Credit-Szene tötet Mystique die als Verbündete getarnte Val Cooper, nimmt deren Identität an und späht Informationen über Graydon Creed aus – ein Ausblick auf die kommende Staffel.