Die zweite Staffel knüpft unmittelbar an das Finale der ersten an: Lucy MacLean reist gemeinsam mit dem Ghul weiter in Richtung New Vegas, wo ihr Vater Hank die geheimen Pläne von Vault-Tec vorantreibt.
Unterwegs stoßen die beiden auf das hinter einem Autokino verborgene Vault 24. In diesem Vault wurde einst Houses Gedankenkontroll-Technologie getestet, indem man die Bewohner zu Kommunisten umerzog. Hank hat die entsprechenden Geräte bereits geborgen; als Lucy und der Ghul auf einen Überlebenden mit implantiertem Apparat treffen, dessen Kopf explodiert, verhärtet sich Lucys Entschlossenheit, ihren Vater aufzuhalten.
Zugleich führt die Folge Robert House ein – den von Justin Theroux gespielten Technologie-Herrscher von New Vegas. Er demonstriert seine Gedankenkontroll-Apparatur an Bauarbeitern; als er die Einstellungen justiert, explodiert der Kopf eines Mannes.
In einem weiteren Handlungsstrang sitzt Norm noch immer mit dem konservierten Gehirn von Bud Askins fest und muss einen Ausweg finden, bevor ihm Nahrung und Wasser ausgehen, während er den Plänen seines Vaters nachspürt. Hinweise deuten darauf, dass Hank Vault 24 in gestohlener Powerrüstung aufgesucht hat.
