Nach der Niederlage des Jokers und dem Verschwinden Batmans hat ein Erdbeben der Stärke 8,6 das ohnehin zerstörte Gotham endgültig verwüstet. Der US-Präsident erklärt die Stadt in einer Notansprache zur „civitas non grata“ und trennt sie offiziell von den Vereinigten Staaten ab. Harley Quinn feiert das entstandene Machtvakuum als ihren Traum von einer hierarchielosen Stadt: Sie zieht mit ihrer Crew randalierend durch Gotham und verschleppt den Sushi-Koch Takashi, damit er im Gotham Mall für sie kocht.
Poison Ivy hält ihr vor, dass sie die Wochen seit dem Tod des Jokers mit Feiern verbracht hat, statt das Machtvakuum zu füllen, und warnt sie vor den Folgen. Tatsächlich formieren sich die verbliebenen Schurken – Pinguin, Riddler, Bane, Two-Face und Mr. Freeze – nach dem Zerfall der Legion of Doom zur Injustice League, um ihre abtrünnigen Handlanger zurückzuholen und wieder eine Ordnung zu erzwingen. Unterdessen versucht Commissioner Gordon vergeblich, Batman zu erreichen; Robin berichtet ihm, Batman sei beim Einsturz von Jokers Turm verschüttet worden.
Harley lehnt die Kontrolle der Injustice League ab. Als diese ihr nur ein winziges Gebiet zugestehen will, zertrümmert sie den Tisch und die vorgelegte Karte und weigert sich beizutreten – woraufhin Mr. Freeze sie in einen Eisblock verwandelt. Zwei Monate bleibt Harley eingefroren, während die Injustice League ganz Gotham unter sich aufteilt. Gordon verliert die letzten Reste des GCPD und steht schließlich allein da, als seine Frau die Scheidung verlangt.
Der Pinguin behält Harleys Eisskulptur als Trophäe. Auf seiner Feier schleusen sich Ivy und der Rest der Crew getarnt ein: Sy Borgman lenkt mit Nebel und einem lautstarken Geburtstagsständchen ab, Doctor Psycho lässt die Skulptur zu Boden gleiten. Es kommt zum Kampf, bei dem Harley aus dem brechenden Eis befreit wird. Sie beißt dem Pinguin die Nase ab und tötet ihn schließlich, indem sie ihm das abgebrochene Ende ihres Baseballschlägers in die Kehle stößt.
Später erfährt Harley von ihrer Crew, dass sie zwei Monate im Eis steckte und dass allein Clayfaces Plan die Rettung brachte. Als sie hört, dass die Injustice League die Stadt in „New New Gotham“ aufgeteilt hat, gibt sie zu, dass Ivy recht hatte, und schwört, die gesamte Injustice League auszuschalten und Gotham für sich zu beanspruchen. Zugleich wird Bruce Wayne unter den Trümmern gefunden – bewusstlos, aber am Leben.