Godzilla jagt Titan X bis zur Sturmwand vor Skull Island. Dort lässt er die Kreatur dem abtrünnigen Team von Isabel Simmons folgen, das ihr Ei zurückholen will, und kehrt selbst nach Axis Mundi zurück, nachdem er seine Aufgabe erfüllt hat, die Ordnung im Titanen-Ökosystem zu wahren.
Das Monarch-Team von Outpost 18 landet mit zwei Zielen auf Skull Island: Titan X zurück nach Axis Mundi zu bringen und Cate sowie Kentaro zu finden, die dort als „Gäste“ von Isabel Simmons festgehalten werden.
Simmons und der Apex-Konzern wollen Axis Mundi – die Verbindung von der Erde zur Hohlwelt, der Heimat der Titanen – für Zeitreisen nutzen. Dafür soll Titan X kontrolliert und gegen Kong, den Beschützer der Insel, eingesetzt werden.
Kentaro gesteht, dass er sich an dem Projekt beteiligt, um seinen Vater Hiroshi vor dem Tod zu bewahren.
Keiko und Shaw folgen Bill Randas alten Karten möglicher Risse. Sie entdecken Sonden, die Bill rund um die Welt durch Risse geschickt hat und die alle am selben Knotenpunkt des Titanen-Netzwerks gelandet sind. Jede enthält einen Brief an Keiko mit den Ehegelübden, die er an ihrem Hochzeitstag nicht in Worte fassen konnte.
Im Finale steigert Isabels Team mithilfe von Implantaten die Aggression von Titan X. Die Kreatur brüllt und ist bereit, sich Kong im Kampf zu stellen.
