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Thomas Wayne wird verhaftet und im Tower of London eingesperrt, während Martha sich einer lebensrettenden Operation unterzieht. Patrick heuert Alfred an, Thomas ohne Virginias Wissen aus dem Tower zu befreien und in die USA zurückzuschicken – für eine Million Pfund. Glubb, der Martha nicht erreichen kann, erhält über eine Telefonzelle ein Angebot eines Unbekannten.
Mit einem Enterhaken und einem automatischen Dietrich von Lucius befreien Alfred und Daveboy Thomas aus dem Tower und werden dadurch zu Gesuchten; Premierminister Aziz sorgt jedoch dafür, dass keine Anklage erhoben wird. Daveboy besucht auf Sallys Wunsch eine Galerieausstellung und lernt dort den Künstler Francis Foulkes kennen. Alfred bringt Thomas in sein Zuhause und stört dabei ein Date seiner Mutter.
Da Thomas das Land nicht ohne seine Familie verlassen will, stellt Alfred Patrick zur Rede. Dabei kommt heraus, dass die abtrünnige CIA-Agentin Virginia Patricks Führungsoffizierin ist und die Gedankenkontroll-Drogen weiterentwickeln will. Sie zieht eine Waffe, und Patrick offenbart, dass Virginia Agenten losgeschickt hat, um Martha zu töten – doch die von Alfred vorab alarmierte Polizei stürmt herein und verhaftet alle.
Im Krankenhaus warten Aziz und die Polizei bereits auf die CIA-Agenten; Martha hat die Operation überstanden. Alfred wird freigelassen, trifft in seinem Büro auf Sandra, und die beiden kommen sich näher. Unterdessen begegnet der gefesselte Glubb seinem geheimnisvollen Verbündeten – einem Mann mit Guy-Fawkes-Maske.
Die Beziehung zwischen Thomas und Martha Wayne leidet weiter unter dem per Gedankenkontrolle erzwungenen Mordanschlag; die beiden schlafen in getrennten Zimmern. Überraschend taucht Thomas' Schwester Patricia auf und quartiert sich bei den Waynes ein. Als Thomas ausspricht, wie sehr ihn Patricks Verhalten belastet, gibt ihm das den Anstoß, mit seiner Waffe nach Gotham aufzubrechen, um ihn zur Rede zu stellen.
Premierminister Aziz engagiert Alfred als Personenschützer für Zahra Khin, die Anführerin der Rebellen der ehemaligen britischen Kolonie Kalpoor. Khin ist für einen Gipfel in London, wird von der britischen Regierung aber nicht offiziell unterstützt. Nachdem Alfred einen Anschlag auf sie vereitelt hat, bringt er sie in seine Bar, wo sich ihr eigener Sicherheitschef als Verräter entpuppt – gefesselt und geknebelt übergeben sie ihn dem kalpoorischen Präsidenten.
Später begleitet Alfred Zahra auf ihr Hotelzimmer, wo die beiden miteinander schlafen. Zahra offenbart, dass sie in London ist, weil sie erfahren hat, dass ihr angeblich vor zehn Jahren ermordeter Vater noch am Leben sein soll. In der Bar gesteht Alfred einem noch halluzinierenden Daveboy, dass sie selbst es waren, die Zahras Vater damals entführt hatten.
Daveboy besucht auf Sallys Wunsch eine von Francis organisierte Kunstausstellung, bei der Farbe über leere Leinwände und die Gäste gegossen wird. Sally überredet ihn, mit ihr eine Droge zu nehmen, die angeblich ihre Träume verbinden soll. Es zeigt sich, dass Glubb für Foulkes – den Mann mit der V-Maske – arbeitet und ausgewählten Gästen die Droge Lullaby State verabreicht hat, ohne konkrete Anweisungen, sodass ihre Wirkung offenbleibt.
Bet Sykes spürt Mrs. Gaunt auf, die inzwischen als Ärztin arbeitet. Gaunt versucht, Bet von ihrer Rache abzubringen, und bietet an, ihr das Baby abzunehmen, was Bet ablehnt. Gaunt verrät schließlich, wo Bet John Salt findet, bittet aber um möglichst wenig Blutvergießen. Bet stöbert Salt auf und schießt mehrfach auf ihn – doch er bleibt unbeeindruckt und erhebt sich wieder: Er ist inzwischen ein Cyborg. Bet wird gefangen genommen.
Nach einem Angriff auf ein Umspannwerk helfen Alfred, Daveboy und Martha dem Politiker Gulliver Troy dabei, das oeffentliche Ansehen der Begabten (PWEs) wiederherzustellen. Alfred wirkt dabei gedaempft und ist von dem Gefaengnis-Coup der Vorepisode noch sichtlich gezeichnet.
Im Hintergrund kehren die Bewusstseinskontroll-Droge Lullaby und die Guy-Fawkes-Masken in die Handlung zurueck: Dr. Glubb versucht, Foulkes ruecksichtslosen Einsatz des Mittels zu stoppen. Zugleich sorgt ein Brief von Sandra an Daveboy fuer Aufregung, denn er offenbart, dass Sandra schwanger ist und Alfred moeglicherweise Vater wird, was zu einem komoediantischen Wortgefecht zwischen den beiden Freunden fuehrt.
Im Zentrum steht Captain Blighty, der den Auftrag hat, einen begabten Gegner auszuschalten, der sich vom Stromnetz naehrt. Der Bösewicht greift Blighty an, dieser haelt zunaechst dagegen, verliert dann aber die Kontrolle ueber seinen Anzug, sodass Alfred und Daveboy ihn retten muessen. Um Alfred aus dem gefaehrlichen Kampf herauszuhalten, schlaegt Blighty ihn bewusstlos und opfert sich schliesslich selbst, um den Gegner endgueltig zu stoppen.
Sandra lehnt Alfies Heiratsantrag ab: Sie will das gemeinsame Kind allein großziehen und Alfie nur als Vater teilhaben lassen. Nach einem Streit schlägt sie ihm die Tür vor der Nase zu. Zugleich kehrt Thomas Wayne, der in Gotham seinen Vater getötet hat, zu Martha und der kleinen Samantha nach London zurück. Martha ist weniger über den Mord erzürnt als darüber, dass er die Familie in Gefahr bringt.
Eine Gestaltwandlerin, die sich als das Kindermädchen Mary ausgibt, entführt Samantha und fordert von Thomas 100.000 Pfund. Parallel dringt Lucius Fox in die geheime Regierungseinrichtung Level 7 ein und wird Zeuge tödlicher Experimente an Gefangenen, während Daveboy mit Sally und Patricia den Mord auf Foulkes' Dinnerparty untersucht.
Um Samanthas Sicherheit zu erkaufen, gesteht Thomas öffentlich den Mord an seinem Vater. Die falsche Mary entpuppt sich als Regina, die Rache an der Familie Wayne nehmen will und Thomas befiehlt, Martha zu töten. Statt zu gehorchen, greift Thomas sie an; Martha erschießt Regina.
Im Level 7 versucht die betäubte Bet Sykes zu fliehen, während Lucius die gefangenen Enhanced befreit; auch Peggy Sykes kehrt zurück. Alfie berichtet Mary von Sandras Schwangerschaft. Am Ende künden Milchmänner mit Foulkes' präparierter Lieferung den Anbruch eines neuen Tages an.
Die von Francis Fuchs entwickelte Droge Lullaby ist über die Londoner Milchversorgung freigesetzt worden: Ein Großteil der Bevölkerung, der die Milch getrunken hat, verfällt in mörderischen Wahnsinn. Zugleich hält General Thursday Lucius Fox auf der militärischen Ebene -7 gefangen, wo an übermenschlich Begabten (PWE) experimentiert wird. Kurz vor seiner Gefangennahme kann Lucius zusammen mit Bet Sykes noch einen Hilferuf an Alfie absetzen.
Nach einem Streit überredet Martha ihren Mann Thomas, sie und Alfie Lucius befreien zu lassen. Premierminister Aziz gibt zwar sein Einverständnis, trinkt dann aber ahnungslos mit Lullaby versetzten Tee. Alfie und Martha dringen in Ebene -7 ein, überwältigen Thursdays Truppen und nehmen ihn als Geisel, um Bet und Lucius zu befreien. Fox bringt die gefangenen PWE mit an die Oberfläche und sabotiert die Anlage, um Thursday einzuschließen.
In der Stadt stellen Daveboy und Sally den verantwortlichen Fuchs zur Rede, der jedoch von seinem eigenen berauschten Mob totgeprügelt wird. Alfie hört das Lied „Candlesticks and Caravans“, das ihn an Sandra erinnert, und eilt ihr zu Hilfe. Sandra will zunächst nicht mit ihm gehen, schließt sich ihm dann aber an, als beide vor der wütenden Menge fliehen.
Martha kehrt mit den Geretteten ins Wayne-Haus zurück; sie und Thomas versöhnen sich und beschließen, London als Familie für einige Tage zu verlassen. Der eingeschlossene General Thursday hält indes die bedrohlichen Anrufe des von Lullaby verwirrten Aziz für einen Putschversuch des Premierministers.
Im Queen Anne's macht Alfie Sandra vor allen einen Heiratsantrag, den sie annimmt. Die Gruppe verlässt London in einem roten Doppeldeckerbus und nimmt unterwegs die Waynes mit. Draußen findet die titelgebende Highland-Hochzeit von Alfred Pennyworth und Sandra Onslow statt, mit Lucius als Traurednern – doch noch ehe das Paar seine Gelübde beenden kann, lässt Thursday einen Luftangriff auf die Downing Street fliegen, und das Staffelfinale endet mit der Explosion in der Ferne.
