Die Folge beginnt mit einem Rückblick auf das, was unmittelbar nach dem Staffel-2-Finale wirklich geschah. Während das Feuer in der verschlossenen Kammer wütet, brechen Shirley, Knox und die anderen die Tür auf und ersticken die Flammen. Sowohl Juliette als auch Bernard werden lebend geborgen und über eine improvisierte Seilzugkonstruktion in die Tiefe des Silos hinabgelassen, wo die Bewohner aller Ebenen das Geschehen ungläubig verfolgen. Offen bleibt zunächst, wie Bernard in den untersten Bereich des Down Deep gelangte, während Juliette heute als Bürgermeisterin an der Spitze steht.
Bevor Bernard es erklären kann, tritt Robert Sims aus dem Schatten und dreht das bisherige Verständnis der Ereignisse um: Statt Juliettes Gegner ist er einer ihrer wichtigsten Verbündeten. Auf Befehl der Order sollte Camille Bernard töten lassen, und Sims wurde mit der Ausführung beauftragt. Er zieht die Erstickung mit der Plastiktüte bis zum letzten Moment durch, schneidet den Beutel dann aber auf und lässt Bernard am Leben. Der Grund: Bernards letzte Worte drehten sich darum, dass allein Juliette weiß, wie sich Silo 18 davon abhalten lässt, in eine Gaskammer verwandelt zu werden.
Sims bringt Bernard an einem Ort unter, den nie zuvor ein Offizier betreten hat, und sorgt über seine Kontakte dafür, dass Juliette zur Bürgermeisterin wird - so bleibt sie am Leben und stets in seiner Nähe. Hinter verschlossenen Türen stellt er ein Team zusammen, das ihr Gedächtnis wieder in Gang bringen soll. Eine kleine Kiste mit Juliettes Habseligkeiten, darunter die Seite aus dem Naturbuch, löst einzelne Bilder in ihrem Kopf aus, doch die Fragmente fügen sich noch nicht zu einem ganzen Bild zusammen.
Parallel setzen sich Shirley, Knox und die anderen mit Martha Walker zusammen, die sich ebenfalls als Verbündete von Sims entpuppt. Sie enthüllt der Gruppe die Wahrheit über die Silos: Es gibt rund fünfzig davon. Die Nachricht erschüttert das Weltbild der beiden, doch sie begreifen rasch, dass Juliette eines dieser Silos aufgesucht und dort die Wahrheit über die Welt erfahren haben muss. Kurz darauf stoßen auch die Outsiders hinzu, die nach ihrem Gespräch mit Lucas Kyle ihre Haltung geändert haben. Gemeinsamer Gegner der Allianz ist Camille.
Auf dem Weg nach oben bricht Sims zusammen: Juliettes Rückkehr hat unbeabsichtigt sein Verhältnis zu seinem Sohn erneuert und gestärkt, wofür er ihr danken will. Er hatte Georges PEZ-Spender heimlich als Trostobjekt für sich und seinen Sohn benutzt und gibt ihn nun an Juliette zurück. Das Relikt erinnert sie an die Nachricht, die George darauf hinterlassen hat - und die Erinnerungen brechen wie ein Damm über sie herein. Juliette weiß nun wieder von dem Gift und davon, wie es sich stoppen lässt, auch wenn einige Details noch fehlen. Als Camille näher rückt, eilt sie die Treppen hinab, während Sims alles auf diesen Moment setzt.
In der Vergangenheitsebene sind Daniel und Helen weiter auf dem Weg zum Aufenthaltsort ihres Freundes, als das Auto plötzlich die Kontrolle übernimmt und die beiden einem ungewissen, möglicherweise tödlichen Ziel entgegensteuert.
