Nachdem Melanie Laytons Lüge über New Eden öffentlich gemacht hat, ist der Zug erneut gespalten. Wilford nutzt das Chaos, stellt eine Armee zusammen und will die Kontrolle über den Snowpiercer zurückerobern. Melanie und Layton treffen sich zu einem Waffenstillstand, finden aber keinen gemeinsamen Nenner; Layton und Josie gewinnen den Schwanz des Zuges für die bevorstehende Schlacht.
Als Roche ein Ultimatum stellt, erkennt Layton, dass er kein weiteres Blutvergießen ertragen kann. Gemeinsam mit Melanie überlistet er Wilford und zwingt ihn in denselben kleinen Waggon, in dem einst Melanie überlebte; mit Vorräten für sechs Monate wird der Waggon auf ein Nebengleis gehoben. Anschließend beschließen Melanie und Layton, den Zug zu teilen und die Passagiere abstimmen zu lassen.
Die Passagiere wählen ihre Seite: Alex, Ruth, Javi und Josie schließen sich Layton auf dem Weg nach New Eden an, während Ben, Bess, Miss Audrey und Miles bei Melanie auf dem Hauptgleis bleiben. Laytons Zug erreicht über eine gefährliche, brüchige Strecke schließlich New Eden – eine überraschend warme, schneefreie Region mit Wasser und Sonne, in der die Menschen erstmals seit dem Freeze ohne Kälteschutzanzug ins Freie treten.
Drei Monate später beobachtet Melanie auf ihrem Zug eine Explosion am Himmel – ein Hinweis darauf, dass es weitere Überlebende geben könnte. Das Staffelfinale lässt offen, wer dahintersteckt, und bereitet die vierte Staffel vor.
