Nachdem Gwyns Erinnerungen zurückgekehrt sind, sieht sich die Crew der USS Protostar die Holodeck-Aufzeichnung an, in der der Diviner von seiner Mission und der wahren Natur des Schiffs erzählt. Dabei offenbart Gwyn, dass ihr Vater aus der Zukunft stammt. An Bord verbirgt sich eine Waffe, die Sternenflotten-Schiffe gegeneinander aufbringen soll — und Hologramm-Janeway muss erkennen, dass sie von dieser Bedrohung auf ihrem eigenen Schiff nichts wusste.
Die Crew durchsucht Deck für Deck, findet die Waffe aber erst, als Zero bemerkt, dass die Brücke noch fehlt. Ein von Gwyns Erbstück aktiviertes Symbol im Boden öffnet ein geheimes Unterdeck. Dort liegt der sogenannte Living Construct, doch er lässt sich weder abschalten noch zerstören und wehrt Jankom Pogs Phaserfeuer selbstständig ab. Kurz darauf führt ein Näherungsalarm die Crew zu einem reglosen Borg-Kubus, der durch einen neurolytischen Erreger lahmgelegt wurde — denselben, den Admiral Janeway einst im Kollektiv verbreitete.
Gegen den ausdrücklichen Rat von Hologramm-Janeway betritt die Crew den Kubus, in der Hoffnung, das gesammelte Wissen der Borg könnte helfen, die Waffe zu entschärfen. Um auf den Vinculum, den Nervenknoten der Drohnen, zuzugreifen, muss sich jemand ins Kollektiv einklinken. Zero meldet sich freiwillig, da es als Medusaner selbst Teil eines Schwarmbewusstseins war. Während Zero tiefer ins Kollektiv sinkt, erwachen die Drohnen; die Crew wird bis auf Gwyn überwältigt und zur Assimilation vorbereitet.
Auf Janeways Rat legt Gwyn ihre Waffe ab, sodass die Borg sie nicht mehr als Bedrohung wahrnehmen, und befreit die Gefangenen. Doch Zero taucht bereits als Borg-Drohne auf. Gwyn erreicht es mit dem Hinweis, dass sein Schutzversuch ein Akt der Liebe war, und erinnert es daran, dass die Protostar-Crew sein wahres Kollektiv ist — Widerstand sei nicht zwecklos. Zero bricht frei und schaltet mit einer Schockwelle die übrigen Drohnen aus.
Die Protostar entkommt, doch der Living Construct bleibt an Bord und lässt sich nicht entfernen. Weil die Crew damit vorerst nicht zur Sternenflotte zurückkehren kann, folgt sie stattdessen einem Notsignal, um Gutes zu tun — mit Dal als Captain. Unterdessen erreicht die USS Dauntless die zerstörte Relaisstation CR-721. Admiral Janeway erkennt, dass Chakotay nicht mehr das Kommando über die Protostar führt, und schwört, die Verantwortlichen zu stellen. In der Krankenstation erwacht der Diviner mit einem Ruck.
