Zu Beginn der zweiten Folge versucht Mulgarath – getarnt als Dr. Brauer – eine Therapiesitzung mit Jared, doch der Junge misstraut ihm. Unterdessen berichtet Helen, dass Tante Lucinda spurlos aus dem Krankenhaus verschwunden ist. In Wahrheit hat Lucinda endlich den Unsichtbarkeitstrank gebraut, von dem sie immer gesprochen hat, und sich unsichtbar gemacht.
Helen, Jared, der falsche Dr. Brauer und dessen Begleiterin Calliope erreichen das Spiderwick-Anwesen. Während Calliope bei den Kindern bleibt, schließt sich Helen der Suchtruppe an, um nach Lucinda zu fahnden. Um dem unsichtbaren Wesen im Haus auf die Spur zu kommen, streuen Jared und seine Geschwister Mehl auf den Boden, um Fußabdrücke sichtbar zu machen, und stellen Mausefallen auf.
Im Arbeitszimmer des verstorbenen Arthur Spiderwick treffen Simon und Jared schließlich auf Tante Lucinda und den Hauskobold Thimbletack. Lucinda überträgt Jared die Aufgabe, den Feldführer ihres Vaters zu bergen, bevor Mulgarath ihn in die Finger bekommt.
Zum Ende hin lüftet Lucinda die Wahrheit: Dr. Brauer ist in Wirklichkeit Mulgarath, und Calliope ist seine Komplizin – gemeinsam schieben sie Jared ihre Taten in die Schuhe. Mulgarath sticht auf Lucinda ein, doch diese zerfällt lachend zu einem Strauß Blumen.
