Juliette gibt die Suche nach dem verschollenen Lukas Kyle nicht auf und schickt Shirley eine verdeckte Nachricht mit der Bitte um Hilfe. Doch Shirley, noch immer verletzt über Juliettes Gedächtnisverlust, weigert sich, ihr beizustehen. Ein Besuch bei Kathleen Billings bringt Juliette auf eine neue Spur: Sims scheine mehr zu wissen, als er zugibt.
Camille kämpft mit ihrer neuen Rolle als Leiterin der IT. Weil Juliette ihre Medikamente absetzt, drängt der Algorithmus auf einen radikalen Schritt – die gedächtnislöschende Substanz Vitamin D+ soll ins Trinkwasser des Silos eingespeist werden, um die Gemeinschaft ein weiteres Mal von vorn beginnen zu lassen. Andernfalls drohe ein Safeguard.
In den Rückblenden geht Helen, gerade ihres Jobs enthoben, umso entschlossener der gescheiterten Mission von Charlotte nach. Gemeinsam mit Daniel und David trifft sie einen Kontaktmann namens Steve, der über Flugaufnahmen verfügt. Gegen das Klonen von Daniels Kongressabzeichen spielt er ihnen eine Kassette mit rund 20 Sekunden Audio vor – ein Hinweis darauf, dass die Maschinen ferngesteuert übernommen wurden. Als das Team zurückkehrt, um mehr zu erfahren, ist Steves Versteck verwüstet und das Band verschwunden.
Paul verfolgt derweil das Verschwinden von Orla und stößt auf ihren neuen Freund Mike Davidson, der zuvor mit Glenda Harwood liiert war. Seine Ermittlungen enden schockierend: Nahe den Minen entdeckt er Orlas Leiche.
Juliette ist überzeugt, dass die Wahrheit in den Minen liegt und Lukas dort der Schlüssel zu ihrer Erinnerung ist. Sie steigt unter „The Gap“ hinab. Camille kommt zum selben Schluss – Lukas könnte versuchen, sich durch horizontales Graben mit einem anderen Silo zu verbinden. Um ihn aufzustöbern, inszeniert sie einen „Rattenbefall“ und lässt Rauchbomben in den Stollen zünden.
Juliette erreicht die Minen, als das Gas freigesetzt wird. Sie überlässt ihre Atemmaske einem verzweifelten Bergarbeiter und droht zu ersticken, bis Lukas Kyle sich zu erkennen gibt und sie rettet. Juliette fällt ins Koma, Lukas entkommt aus den Minen und läuft direkt in die Reihen der Rebellen. Zum Schluss steht Camille vor einer folgenschweren Entscheidung: Der Algorithmus hält Juliettes Tod für den einzigen Weg, das Silo zu retten.