Ein ungewöhnlicher Fall beschäftigt Team Spidey: Der Schurke Lizard hat einen Kugelfisch gestohlen, der nun in Sicherheit gebracht werden muss.
Zur Unterstützung erhält Spidey Hilfe von Rocket und Groot. Gemeinsam nehmen sie die Verfolgung auf, um den entführten Kugelfisch zu retten und wohlbehalten zurückzubringen.
„Pufferfish Problems“ ist Teil einer Doppelfolge der fünften Staffel und verbindet die Spidey-Helden erneut mit Figuren aus dem weiteren Marvel-Universum.