Ein Jahr nach Homelanders Machtübernahme wiegelt dieser bei einer Bürgerversammlung Anti-Supe-Aktivisten auf, während Annie – als Firecracker verkleidet – in den Kontrollraum eindringt. Dort wird das Video von Flug 37 abgespielt, das Homelander zeigt, wie er sich einst weigerte, die Passagiere zu retten. Nachdem Annie sich gegen Black Noir II durchgesetzt hat, starrt die schockierte Menge ihren Helden an. Homelander will alle töten, doch Sister Sage hält ihn zurück.
Bei einer anschließenden Pressekonferenz erklärt Sage die Aufnahme kurzerhand für KI-generiert – als vermeintlichen Beleg führt Homelander an, dass er im Video sieben Finger habe. Als sich herausstellt, dass ein Bühnenmanager das Material geleakt hat, tötet Homelander ihn. Zugleich befiehlt er The Deep und Black Noir, den untergetauchten A-Train aufzuspüren, und lässt durchsickern, dass Hughie, Frenchie und Mother’s Milk – gefangen in einem „Freiheitslager“ – in weniger als 76 Stunden hingerichtet werden sollen.
Butcher scheint seinen Vater Sam zu töten, auch wenn die Tat nur angedeutet wird. In Manila findet er Kimiko, die sich dort versteckt hält, und bringt sie zurück; überraschend kann sie inzwischen sprechen. Gemeinsam mit Annie planen sie, ihre gefangenen Freunde zu befreien – obwohl allen klar ist, dass die angekündigte Hinrichtung eine Falle ist, um Annie zu schnappen.
Unterdessen ist Barrett zur Vizepräsidentin aufgestiegen und mit dem tiefreligiösen Supe Oh-Father verlobt; Sage verlangt von ihr, jeden zu verhaften, der sich online kritisch über Homelander äußert. Annie versucht, A-Train für die Rettungsaktion zu gewinnen, doch der lehnt ab, um seine in Frankreich versteckte Familie zu schützen. Am Strand stellt er The Deep zur Rede und lässt ihn schließlich ziehen.
Butcher findet einen Supe mit wurmartigen Fähigkeiten, der sich durch das Erdreich gräbt und die Gruppe in das unterirdische Lager bringt. Dort erwartet sie jedoch bereits Homelander, der Hughie, Frenchie und Mother’s Milk geknebelt auf den Knien festhält. Starlight blendet ihn mit ihren Kräften und den Lampen des Lagers, sodass ihre Freunde entkommen können.
Im folgenden Chaos tötet Mother’s Milk einen Wärter, Butcher nimmt es mit einem Scharfschützen auf, und Frenchie bringt seinen von Homelander zugerichteten Partner in Sicherheit. Als Homelander Hughie töten will, verlangsamt dieser die Zeit und rettet Mother’s Milk; A-Train zieht Hughie aus der Gefahr. Homelander erkennt A-Train und jagt ihn aus dem Lager. Auf der Flucht weicht A-Train – anders als einst bei Hughies Freundin – einer Passantin aus, verliert dabei seine Brille, stolpert durch den Wald und wird von Homelander an einen Baum gedrückt. Nachdem A-Train ihn „erbärmlich“ nennt, bricht ihm Homelander das Genick.