Rückblenden auf den sogenannten „Zero Day" zeigen, wie der General, Amanda Waller und ihre Truppen einst von einer außerirdischen Armee angegriffen wurden. Angeführt wurde sie von einer gepanzerten, Superman ähnlichen Gestalt mit dem Codenamen „Nemesis Omega". Ein rätselhaftes Ereignis zwang die Angreifer schließlich zum Rückzug und ließ ihre Technologie zurück.
In der Gegenwart verhört der General den gefangenen Superman, um mehr über den Zero Day zu erfahren. Dessen schmerzhafte, ratlose Reaktion lässt den General an einer Verbindung zweifeln. Waller hilft den Gefangenen heimlich zur Flucht, während die Newskid Legion Lois und Jimmy bei der Suche nach Superman unterstützt. Ein rachsüchtiger Ivo greift Superman an, befreit ihn dabei aber unbeabsichtigt.
Clark fürchtet, er sei zur Zerstörung der Erde geschickt worden, doch Lois überzeugt ihn vom Gegenteil. Als Ivo das Stromnetz anzapft und Metropolis verwüstet, rufen Lois und Jimmy über soziale Medien die Bürger auf, ihren Strom abzuschalten – das schwächt Ivo, sodass Superman ihn mit seiner neu erwachten Röntgensicht ausschalten kann. Während Superman und Lois einander ihre Liebe gestehen, findet Jimmy die geheimnisvolle „Akte X". Zugleich wird der General auf Anweisung von Checkmate abgesetzt und erhält von Waller die Omega-Kanone mit dem Befehl, Superman zu töten.
