Das Staffelfinale spielt am Thanksgiving-Fest auf der Kent-Farm – doch aus dem Feiertag wird ein Kampf ums Überleben, als die Task Force X, Familiengeheimnisse und Kryptonit aufeinanderprallen. Clark plagt zunächst ein Albtraum, in dem der geheimnisvolle Kryptonier Nemesis Omega Lois und Jimmy tötet und die Erde verwüstet. Entsetzt erkennt Clark, dass Omega sein eigenes Gesicht trägt.
Beim Familientreffen macht Lois eine bittere Entdeckung: Ihr eigener Vater Sam Lane ist der ominöse General, von dem die ganze Zeit die Rede war. Clark erkennt in ihm sofort jenen Anführer wieder, der ihn zusammen mit der Task Force X gefangen genommen hatte.
Lois stellt ihren Vater zur Rede, weil er als General versucht hat, Superman zu töten. Sam beteuert, er wolle damit nur sie und alle anderen vor der drohenden Invasion schützen.
Da wird das Haus der Kents unvermittelt von einem kryptonischen Schiff angegriffen – kurz darauf droht eine ganze Flotte aufzutauchen. Superman rammt das Raumschiff und drängt es über die Wolkendecke, kämpft sich ins Innere und wird dort von weiteren kryptonischen Robotern attackiert. Die KI von Jor-El hilft ihm, die Maschinen zu zerstören.
Schließlich setzt Superman Kryptonit ein, um das Herz des Schiffes zu vernichten. Das Portal schließt sich, das Schiff wird in zwei Hälften gespalten – eine stürzt zurück zur Erde, während Superman in der anderen Hälfte gefangen bleibt und die Handlung auf einem dramatischen Cliffhanger endet.
