Nachdem Clark Kent seine Kräfte verloren hat, steht er vor einer existenziellen Krise – doch Lois Lane hält ihm den Rücken frei. Da tauchen mit Jonathan und Lara Lane seine und Lois’ Kinder aus einer düsteren Zukunft in Metropolis auf. Die Geschwister sind mit einer klaren Mission gekommen: Sie wollen Lex Luthor töten, um die dystopische Zeitlinie zu verhindern, in der er die Welt mit einer Armee von Eradicators unterworfen hat.
Bei Lexcorp enthüllt sich Lex’ verstörendstes Projekt. Aus Supermans DNA hat er einen Klon erschaffen und ihm eigenes Hirnmaterial eingepflanzt, das er über einen speziellen Helm steuert – den Eradicator. Amanda Waller, die Lex einst zu Task Force X geholt hat, misstraut einer Kreatur, die sich selbst reparieren, lernen und weiterentwickeln kann. Auf Anraten von Slade Wilson stellt sie das Projekt ein und lässt Lex verhaften.
Als Lara heimlich losstürmt, um Lex während seines Treffens mit Waller zu töten, setzt der in Panik geratene Lex den Eradicator zur Verteidigung frei. Die Kreatur wird eigenständig, sperrt Lex komplett aus dem System aus und verwandelt die Episode in einen Überlebenskampf. Clark, Kara, Lois und Jimmy Olsen eilen zu Lexcorp, doch als der Eradicator den Boden aufreißt, stürzen Lois und Clark in die mit Blei ausgekleideten Kanäle, die alle Kräfte lahmlegen.
Kara wird zum emotionalen Zentrum der Folge: Sie entfesselt mehr ihrer verborgenen Macht gegen den Eradicator, wird aber in die Augen getroffen und wirft sich schließlich schützend vor Jonathan und Lara. Jimmy bestätigt, dass sie kaum noch am Leben ist und nicht erwacht. Während Kara und Lara außer Gefecht sind, versucht Jonathan allein gegen den Eradicator anzutreten – doch die Kreatur raubt ihm sein Zeitreise-Gerät und verschwindet im Zeitstrom.
Clarks Handlung endet ebenso erschütternd: In der Hoffnung, die Festung der Einsamkeit könnte seine Kräfte zurückgeben, lässt er sich von Bizarro dorthin bringen. Doch die Drohnen der Festung wenden sich gegen ihn, und Bizarros rot glühende Augen deuten an, dass Brainiac die ganze Zeit dort verborgen überlebt hat, ehe er Clark von hinten niederstreckt. Zwei Folgen vor dem Staffelende ist das Haus El so zerrissen wie nie.
