In „Quallen quält man nicht" (Originaltitel „A Jellyfish Tale") verlagert sich das Geschehen unter Wasser: Der Schurke Doc Ock beginnt, mit seinen mechanischen Tentakeln am Meeresboden zu bohren.
Was Doc Ock dabei nicht bedenkt: Seine Grabungen bringen den Lebensraum einer Kolonie von Tiefseequallen in Gefahr. Die empfindlichen Meerestiere werden durch die Störung am Meeresgrund bedroht.
Team Spidey – Spidey, Spin und Ghost-Spider – nimmt sich der Sache an, um die Quallen zu schützen und Doc Ocks Bohrarbeiten zu stoppen. Die Spinnenhelden müssen dafür ins Wasser und einen Weg finden, den Lebensraum der Tiere zu bewahren.
Am Ende können die jungen Helden die Tiefseequallen in Sicherheit bringen. Nebenbei vermittelt die Folge den jüngsten Zuschauern, wie wichtig es ist, Rücksicht auf empfindliche Lebensräume im Meer zu nehmen.
