Die Folge führt die beiden Handlungsstränge der Staffel parallel weiter. Im All sitzen Sharon Garnet und Ian auf der klongefüllten Ark 22 fest, die sich im Überlichtflug befindet, während Admiral Hammond auf der Ark One nur allzu bereitwillig das Kommando übernimmt und die beiden fast zurücklässt. Garnet und Ian müssen mit Köpfchen einen Weg von Bord finden.
Auf der Kolonie Homebase 1 erschüttert eine mysteriöse Explosion die Siedlung. Eva geht dem Tod von Brice nach, während Trust sie mit einem Ablenkungsmanöver rund um die Wasserstelle der Kolonie auf eine falsche Fährte zu locken versucht. Zugleich fällt Trust auf, dass ein hereingebrachter Mann Angus' Kleidung trägt.
Angus und Kelly sind seit dem Angriff zu Beginn der Staffel gefangen. Angus erkennt, dass die zerbrochenen Felsen ein zu lösendes Rätsel sind, und liefert damit einen Hinweis auf die indigene Bevölkerung des Planeten, die die Ark-Überlebenden offenbar sabotiert. Garnet gerät zudem mit Kimi und Alicia aneinander, nachdem diese sich Hammonds Befehlen widersetzt haben.
Die größte Enthüllung kommt zum Schluss: Sharon ist ein Gen-3-Klon – eine Generation, die für schwere psychische Störungen bekannt ist. Das rückt vieles über Garnets Vergangenheit in neues Licht und wirft zugleich Fragen über Hammond auf, dessen Akte zwar seinen Rang als Admiral bestätigt, an dem aber etwas nicht stimmt.
