Kaum hat die Besatzung von Ark One die Nachwirkungen ihrer jüngsten Zeitschleife verarbeitet, lenkt ein Notsignal das Schiff zur Ark 16 um. Dort stellt sich heraus, dass sämtliche Personen an Bord von einer rätselhaften Seuche befallen sind. Der Erreger greift rasch auf die Crew von Ark One über und zwingt das Schiff in den Quarantänemodus.
Dr. Sanjivni Kabir übernimmt die Suche nach der Infektionsquelle und die Entwicklung eines möglichen Gegenmittels. Dabei zieht sie Angus Medford und dessen botanisches Fachwissen hinzu, um die Krise im All mit den Rätseln auf dem Planeten zu verknüpfen.
Auf Homebase untersuchen Zed, Trust und Felix Strickland derweil Wrackteile auf der Planetenoberfläche. Der Fund wird für Zed zutiefst persönlich: Die Trümmer stammen von einem EF-Schiff – und zwar von der EF-1, jenem Schiff, an dessen Bord sein Sohn war, als es verschwand.
So niederschmetternd die Entdeckung ist, birgt sie einen Funken Hoffnung. Nahe dem Wrack werden Leichen gefunden, die jedoch nicht alle Insassen der EF-1 erklären – was die Möglichkeit offenlässt, dass Zeds Sohn irgendwo auf dem Planeten noch am Leben ist. Für Zed bedeutet das Herzschmerz und Hoffnung zugleich. Zugleich verdichtet sich der Verdacht rund um Ves, deren frühere kryptische Gespräche mit Milan im Licht der EF-1-Enthüllung neue Bedeutung gewinnen und auf mögliche Verbindungen zur Organisation Black Thorne hindeuten.