Auf einer Außenmission stranden La'an Noonien-Singh, Spock und James T. Kirk an Bord der USS Griffin - eines Sternenflottenschiffs, das seit neun Jahren als verschollen gilt und dessen komplette Besatzung spurlos verschwunden ist. An Bord treibt eine bösartige Wesenheit ihr Spiel, die die Gestalt der ehemaligen Sicherheitschefin Rose Harper annimmt. Die Griffin isoliert die drei Offiziere voneinander und nährt sich von ihren tiefsten Ängsten, wobei sie es besonders auf La'an abgesehen hat.
Als Harpers Gegenstück im Sicherheitsdienst wird La'an zur Hauptzielscheibe. Die Wesenheit greift ihre verdrängte Angst auf, durch die Ereignisse der Vorstaffeln zu einem Monster zu werden und ihrem Vorfahren Khan immer ähnlicher zu sein. La'an wehrt sich lange gegen die Beeinflussung, unterliegt ihr aber schließlich: Sie versucht, Erica Ortegas in sich hineinbeamen zu lassen, will Uhura erstechen und rammt Kirk schließlich ihren Dolch in den Leib. Von diesen drei Angriffen ist nur der auf Kirk real - Ortegas und Uhura sind Trugbilder.
Spock wird von einer Manifestation seiner früheren Verlobten T'Pring heimgesucht. Seine Logik hält daran fest, dass sie nicht echt ist und ihre Argumente lediglich aus seinen Erinnerungen stammen. Daraufhin betäubt ihn die Erscheinung mit einem Phaser und fesselt ihn auf eine Bio-Liege. Die Folge legt Spocks inneren Konflikt neu aus: Insgeheim empfindet er seine vulkanische, nicht seine menschliche Seite als Hemmschuh. Unter dem Einfluss der Griffin schneidet er sich selbst die Ohrspitzen ab, während er glaubt, T'Pring tue es - ebenso wenig sind die vermeintlich rettenden Auftritte von Pike und Una real.
Kirk wiederum wird mit seiner Schuld als abwesender Vater konfrontiert. Kurz zuvor hatte er ein Wochenende mit seinem Sohn David zugunsten einer Konferenz ausfallen lassen, um einen bewunderten Admiral zu treffen - ein nie überreichter Spielzeugroboter steht sinnbildlich dafür. Die Wesenheit spielt diese Reue gegen ihn aus und lässt ihn mitansehen, wie sein Bruder Sam ins Vakuum des Alls gerissen wird. Auch das ist eine Illusion: Der echte Sam ist wohlauf und auf Landurlaub.
Im letzten Moment beamt die Enterprise das Trio von der Griffin herunter, sodass La'an zur Besinnung kommt, bevor sie Kirk vollends tötet. Dr. M'Benga rettet Kirk mit einer Operation, Schwester Chapel stellt Spocks Ohrspitzen chirurgisch wieder her. Captain Pike lässt La'ans Angriff aus seinem offiziellen Bericht heraus und beruhigt ihr Gewissen mit einer eigenen Kindheitserinnerung an einen Spuk. Zum Abschluss zeigt sich jedoch die Erscheinung Rose Harpers, die La'an vom Fenster der Griffin aus beobachtet und ihr bedeutet, das Geheimnis für sich zu behalten.
Zugleich stellt die Episode Division 12 vor - die geheime Abteilung der Sternenflotte für unerklärliche Phänomene, quasi ihre Version der Akte X. Mit einem eigenen Schiff rückt Division 12 an, um die heimgesuchte USS Griffin an einen unbekannten Ort abzuschleppen. Vieles am Ursprung des Spuks bleibt bewusst ungeklärt und deutet an, dass die Geschichte um La'an noch nicht auserzählt ist.
