Das Staffelfinale beginnt mit einem Durchbruch bei der Behandlung von James: Dr. Kabir und Alicia finden heraus, warum die erste Kur versagte. Das Spinnengift zersetzt sich in der künstlichen Atemluft von Ark One, weshalb die Spinnen James direkt beißen müssen, damit ihr Gift mit den übrigen Bestandteilen wirkt. Trotz seiner Angst vor Spinnen lässt James die Bisse zu — die Kur schlägt an, in seinem Blut sind keine Klampkins-Gifte mehr nachweisbar.
Sharon Garnet handelt mit Evelyn Maddox von Ark 15 einen Austausch aus: Spencer gegen die Kur. Maddox und Spencer kommen per Shuttle zu Ark One, doch Maddox' Tochter Kelly hat sich an Bord versteckt. Garnet stimmt zu, besteht aber darauf, dass Kelly gefesselt bleibt. Die Kur wirkt auch bei Maddox, doch Kelly befreit sich und versucht, Angus für seinen Verrat zu töten. Alicia streckt sie mit einer Schaufel nieder; Kelly wird zurück auf Ark 15 gebracht.
Mehrere Handlungsstränge finden zum Abschluss: Spencer kehrt auf die Brücke zurück, Cat wird aus dem Hausarrest entlassen, James und Eva kommen sich näher, und Alicia und Angus verbinden die Erfahrung, jeweils von ihrem ersten Kuss verraten worden zu sein. William Trust jedoch aktiviert nur eines der Geräte und richtet dessen Magnetimpuls auf Ark 15, sodass das Schiff auf Proxima B zurast. Ark One schaltet den Magneten ab und rettet beide Schiffe; Garnet zwingt Trust, den Fehler zu beheben.
Alicia aktiviert schließlich alle Rotationsgeräte, und Proxima B beginnt sich zu drehen — dabei zeigt sich, dass der Planet praktisch eine Bombe ist. Die Schiffe entkommen der Explosion, doch Trümmer treffen Ark One und beschädigen alle Decks. Maddox, dankbar für ihre Rettung, sagt Hilfe zu und bietet an, die verbliebene Besatzung von Ark One auf Ark 15 aufzunehmen. Die neue Allianz beendet den Konflikt der Staffel, lässt das Schicksal von Ark One aber offen.
