Im Staffelfinale bringt Jonathan Crane seinen Plan zur Zerstörung Gothams zum Höhepunkt: Er zündet eine erste Bombe, die zahlreiche Menschen tötet, und droht mit weiteren Sprengsätzen, sollten die Titans seine Rätsel nicht lösen.
Statt sich auf Cranes Spiel einzulassen, greift Dick Grayson Wayne Manor direkt an – gemeinsam mit Gar, Jason Todd und dem neu hinzugestoßenen Tim Drake. Sie entschärfen die Sprengsätze und nehmen Crane gefangen. Zugleich rettet ein von Vee angeführtes A.R.G.U.S.-Team Barbara; dabei zeigt sich, dass Vee als Agentin eingeschleust war, um den Lazarus-Pit und die Pläne von Ra's al Ghul zu überwachen, und nun den Titans hilft.
Die übrigen Titans verwandeln den Lazarus-Pit in einen Regen über Gotham – die titelgebende Purple Rain –, der die Opfer der ersten Explosion wieder zum Leben erweckt. Bruce Wayne kehrt in die Stadt zurück; Jason söhnt sich mit ihm aus, bevor er geht.
Es folgen mehrere Abschiede: Conner entwirft ein neues Schiff für Blackfire, die sich von ihm und Kory verabschiedet und nach Tamaran zurückkehrt. Donna schlägt ein Angebot von A.R.G.U.S. aus und verlässt das Team, um Dawn zu suchen. Tim bleibt bei den Titans und erhält von Dick ein Angebot.
Dick verabschiedet sich von Barbara und zieht mit dem Team zurück nach San Francisco. Als letzte Handlung lässt er Rachel die dunkle Magie des Lazarus-Pit auf Crane wirken – der Bösewicht muss fortan die Ängste und Albträume aller anderen durchleben.