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In Blue Valley ist Ruhe eingekehrt: Der totgeglaubte Starman Sylvester Pemberton ist zurück und hat das Haus der Whitmore-Dugans gehütet, während die Familie im Urlaub war. Er gesteht Courtney, dass er sich aus seinem eigenen Grab befreite und unversehrt aufwachte, als sie die Bindung zum Kosmostab einging. Zunächst versichert er, der Stab gehöre nun ihr.
Courtney hofft auf dauerhaften Frieden und will auch den einstigen Schurken der Stadt eine Chance geben – sehr zum Missfallen von Pat, der den Crocks und dem neu aufgetauchten Steven „The Gambler“ Sharpe misstraut. Der Gambler beteuert, sich läutern zu wollen: Er habe von einer Tochter erfahren und wolle ein besserer Mensch für sie werden. Richard Swift dagegen droht ihm und glaubt ihm kein Wort.
Nachdem Sylvester heimlich den Stab für einen nächtlichen Einsatz mit S.T.R.I.P.E. mitnahm, gesteht er Courtney, dass er doch für den Stab zurückkam – er habe kein Leben mehr, zu dem er zurückkehren könne. Da der Stab weiterhin für ihn funktioniert, schließen beide einen Kompromiss: Sylvester nutzt ihn tagsüber, während Courtney in der Schule ist, danach übernimmt sie wieder. Starman ist zurück.
Auch in der neu zusammengesetzten Justice Society sorgt Courtneys Vertrauen für Streit, vor allem um die frisch aufgenommene Cindy Burman und die eifrige Artemis Crock. Als die JSA den Gambler zur Rede stellen will, hören sie einen Schuss und finden seinen Wohnwagen verwüstet – der Gambler liegt tot am Boden, und Cindy kniet mit der rauchenden Waffe daneben. Sie beteuert, es nicht getan zu haben.
Die Folge springt zwölf Stunden zurück: Der reformwillige Steven Sharpe alias The Gambler bezieht seinen neuen Wohnwagen und stellt ein Foto seiner kleinen Tochter Becky auf. Draußen lauert Crock, der seinen Rachedurst niederkämpft und schließlich davonfährt. In der Gegenwart liegt der Gambler erschossen vor seinem Wohnwagen – über ihm steht Cindy Burman mit der Waffe in der Hand. Courtney versammelt die JSA, um den Mord zu untersuchen, auch wenn Sylvester findet, um einen toten Schurken müsse man keine Träne vergießen.
Die Ermittlungen kreisen um zwei Verdächtige: Cindy/Shiv, die über der Leiche gefunden wurde, und The Shade, der zuvor heftig mit dem Gambler aneinandergeraten war. Beths Brille findet keine Schusswunde – der Gambler starb an einem Stich ins Herz, was Cindys Version stützt. Da sein Laptop verschwunden ist, gilt: Wer ihn hat, ist der Mörder. Nebenher hilft Barbara der um Anschluss ringenden Paula Crock beim Backen, und Jakeem und Mike befragen Thunderbolt, der über den Täter nur verrät, er habe „viele Namen“.
Pat und Sylvester stellen The Shade im Diner zur Rede; dieser beteuert, Sharpe einen Neuanfang angeboten zu haben. Als Sylvester nicht lockerlässt, greift er nach Courtneys Stab und feuert auf Shade – doch der Stab gehorcht nur Courtney und kehrt zu ihr zurück. Der sichtlich geschwächte Shade liefert ein Alibi und kündigt an, Blue Valley zu verlassen. Sylvester gesteht Pat seine Schuldgefühle über den einstigen Tod von Bruce Gordon, ehe Courtney ihm hilft, seinen Platz in der Stadt zu suchen. Am Ende versucht Cindy, den erbeuteten Laptop des Gamblers zu knacken, während Rick beunruhigt feststellt, dass mit seiner Sanduhr etwas nicht stimmt.
Der ehemalige Starman Sylvester Pemberton sucht nach seiner aktiven Zeit Halt in Blue Valley, streift durch die Stadt, hält Ausschau nach einem Job und ringt mit der Frage, wer er ohne seine Heldenidentität ist. Pat erinnert ihn daran, dass er kein Sidekick mehr ist und Courtney sowie der JSA ein Vorbild sein sollte; nebenbei erfährt Sylvester, dass Courtney zunächst ihn für ihren Vater hielt, als der Stab erstmals aufleuchtete.
Parallel treibt die JSA die Aufklärung des Mordes an The Gambler voran. Beth erhält über ihre Brille heimlich von Cindy gehackte ISA-Dokumente; daraus geht hervor, dass die Zahlungen an den Gambler per Überweisung von Lawrence Crock stammten. Courtney zögert, Sylvester einzuweihen, um nicht voreilig zu handeln und Artemis nicht erneut die Eltern zu nehmen.
Cindy will sich beweisen und verrät Sylvester, was die Crocks getan haben – doch der misstraut der Tochter des Dragon King und geht auf eigene Faust gegen sie vor. Im Supermarkt stellt er die Crocks mit dem Stab, woraus eine verwüstende Prügelei entsteht; erst als der Stab ihm zu Hilfe eilt und schließlich S.T.R.I.P.E. eingreift, lässt Sylvester von ihnen ab. Bei einem anschließenden Verhör gestehen die Crocks, dass der Gambler sie für ISA-Verbrechen erpresste, die sie nicht begingen; sie zahlten, um nicht ins Gefängnis zurückzumüssen. Lawrence räumt ein, den Gambler vor dessen Tod aufgesucht zu haben, sei aber gegangen, bevor er etwas Unüberlegtes tat – die Crocks sind nicht die Mörder.
Unterdessen kämpft Cameron mit schulischen Problemen, vernachlässigt das Malen und geht auf Distanz zu Courtney; am Ende eilen seine Großeltern aufgeregt aus dem Haus. In der Schlussszene durchsucht Sylvester allein den Wohnwagen des Gamblers, als ihn etwas in die Höhe reißt: Seine Taschenlampe fällt zu Boden, ihm folgt der blutige, bewusstlose Sylvester, während in der Ferne ein Brüllen ertönt.
Nach dem Überfall am Ende der Vorepisode weckt der Stab Cosmo Courtney und fliegt sie zum bewusstlosen Sylvester am zerstörten Trailer des Gamblers. Sylvester kommt ins Krankenhaus; er trägt eine Stichwunde, die jener ähnelt, die den Gambler tötete. Auf Pats Bitte kehrt der frühere Dr. Mid-Nite, Charles McNider, nach Blue Valley zurück.
McNider stellt fest, dass Sylvester ungewöhnlich schnell heilt, und vermutet: Als Sylvester einst starb, durchdrang ihn die kosmische Energie des Stabs Cosmo und hielt seinen Körper über Jahre in einer Art Stasis am Leben. Der Angriff lässt Sylvester zweifeln, ob er den Stab endgültig an Courtney abgeben soll – doch als Pat ihm ein neu genähtes Starman-Kostüm zeigt, entscheidet er, weiter Starman zu bleiben.
Die JSA durchsucht den Tatort erneut. Dr. Mid-Nites Brille findet schließlich eine einzelne, nicht-menschliche Hautzelle. Beim Abgleich erkennt McNider die Probe: Sie gehört Cindys Vater, dem totgeglaubten Dragon King. Die JSA vermutet, dass Dr. Ito – der so viel an sich selbst experimentierte, dass er womöglich unsterblich ist – zurückgekehrt und in den Tunneln unter Blue Valley versteckt ist.
Parallel nähert sich Courtney dem um seine Eis-Kräfte ringenden Cameron. In einem leeren Klassenraum verliert er die Kontrolle, gesteht ihr aber, dass die Kryokinese ein Erbe seiner Familie ist und dass sein Vater als Held getötet wurde. Courtney hilft ihm, die Kräfte über seine Gefühle zu steuern; unter fallendem Schnee küssen sich die beiden schließlich zum ersten Mal.
Am Ende bitten Yolanda und Rick den genesenen Sylvester um Hilfe bei der Suche nach dem Dragon King in den Tunneln, und er willigt ein, das neue Kostüm anzulegen. In den unterirdischen Gängen offenbart sich derweil, dass sich an Cindys Schulter grüne Schuppen bilden – so wie bei ihrem Vater.
Rick entdeckt, dass seine Superkräfte inzwischen über die bisherige Ein-Stunden-Grenze hinaus wirken. Yolanda beichtet ihrem Priester, etwas gestohlen zu haben, verschweigt aber Cindy und die Hintergründe. Nachdem sie in Cindys Zimmer den Laptop des Gamblers gefunden hat, übergibt sie ihn gemeinsam mit Rick und Beth an Sylvester; das Team lädt die Dateien herunter, um Cindy den Mord am Gambler nachzuweisen, und Yolanda soll den Laptop unbemerkt zurücklegen.
Unterdessen trainiert Courtney weiter heimlich mit Cameron dessen Eiskräfte und verschweigt ihm nach wie vor ihre Identität als Stargirl; er formt eine Eisstatue seines Vaters. Besorgt fahren Pat und Barbara zu den Mahkents, um herauszufinden, ob Camerons Großeltern von Courtneys Fähigkeiten wissen und wie gefährlich die Familie ist. Beim angespannten Zusammentreffen geben sich Sofus versöhnlich, während Lily sich offen feindselig zeigt.
Als Yolanda den Laptop zurückbringt, wird sie von Cindy ertappt. Cindy beteuert erneut, den Gambler nicht getötet zu haben und will die Wahrheit erklären, doch Yolanda gibt ihr keine zweite Chance mehr; Rick springt ihr im Kampf gegen Cindy bei. Beth entdeckt die über die Stadt verteilten versteckten Überwachungskameras und kann Courtney alarmieren, als sie den Kampf beobachtet.
Courtney geht dazwischen und stoppt den Kampf. Cindy offenbart schließlich, dass sie sich seit der Rückkehr aus den Shadowlands unfreiwillig in ihren Vater, den Dragon King, zu verwandeln beginnt und in den Dateien des Gamblers nach einem Heilmittel gesucht hat – den Mord aber bestreitet. Enttäuscht bricht sie mit der JSA und verrät Rick und Yolanda, dass Courtney Cameron das Erzeugen von Eiszapfen beigebracht hat.
Bei einer Krisensitzung werfen Rick und Yolanda Courtney vor, Cameron über das Team gestellt zu haben; selbst Beth ist enttäuscht. Weinend schlägt Courtney vor, dass Sylvester die JSA vorerst anführen solle – worauf Yolanda kühl entgegnet, das tue er längst. Sylvester jedoch tröstet Courtney, erzählt von seiner Schwester Mary, die einst mit Brainwave ein Kind hatte, und stellt sich hinter Courtneys Instinkt. Zum Schluss stürmt Beth herein und zeigt, dass das gesamte Team in diesem Moment überwacht wird.
In einer Rückblende – sechs Monate zuvor – legt Jennie zum ersten Mal den Ring ihres Vaters an. Im selben Augenblick wird ihr Bruder Todd Rice von einer dunklen Macht überwältigt und von der Polizei aufgegriffen. Man bringt ihn ins Helix Institute, wo ihm Love und Bones vorgestellt werden.
In der Gegenwart legen Beth und Sylvester das Stromnetz von Blue Valley lahm, während die JSA die überall installierten Kameras aufspürt und zerstört. Yolanda wird von Maria erwischt und aus dem Haus geworfen, als sie sich weigert, ihr Handy herauszugeben; sie flüchtet zu Barbara und Mike.
Shade kehrt zurück und bringt Courtney und Pat zu Jennie unter das Helix Institute. Seit Jennie mit Rückständen dunkler Materie infiziert wurde, ziehen Shade und sie ständig Kraft voneinander. Courtney vermutet, dass die Rettung von Todd diese Verbindung kappen könnte.
Sie finden Todd, der unter einem seine Kräfte unterdrückenden Licht festgehalten wird; er behauptet, er werde die Welt zerstören, sobald man ihn befreit. Als Jennie ihn dennoch befreien will, entfesselt er unabsichtlich eine Welle schattenhafter Energie, die Pat und Shade in die Schattenlande schleudert.
Pat und The Shade sitzen im Schattenreich (Shadowlands) fest – dorthin geraten, als die Lichtkräfte von Jennie und die Schattenkräfte ihres Bruders Todd unkontrolliert aufeinandertrafen. Solange Jennies grüner Lantern-Ring von den Schatten korrumpiert ist, bleibt Shade machtlos und findet keinen Ausgang.
In der Helix-Einrichtung versuchen Courtney und Jennie, den in eine reine Schattengestalt verwandelten Todd zu beruhigen, werden aber von einer Energieentladung niedergestreckt. Courtney erwacht im Büro von Nurse Love, Jennie in einer kräftedämpfenden Zelle. Love und der durchsichtige Mister Bones erklären, Todds Kräfte könnten die ganze Welt im Schatten verschlingen – deshalb dürften die Geschwister niemals vereint sein.
Im Schattenreich konfrontiert der Ort Pat und Shade mit ihren tiefsten Ängsten: Shade begegnet dem Gambler und seiner sterbenden Schwester Emily, an deren Sterbebett er einst nicht erschien, Pat seinem abweisenden Vater und der Andeutung, sein Sohn Mike könnte ihn eines Tages hassen. Pat weigert sich, diesen Einflüsterungen nachzugeben.
Mister Bones offenbart Courtney seine Geschichte – als Folge von Experimenten mit durchsichtiger Haut und einer tödlichen Berührung geboren – und seine Überzeugung, Menschen wie ihn zur Isolation zu erziehen. Courtney überzeugt ihn vom Gegenteil: Jennie sei Todds Rettung. Jennie erreicht ihren Bruder, er nimmt wieder menschliche Gestalt an und absorbiert die Dunkelheit aus ihrem Ring; im selben Moment kehren Pat und Shade aus dem Schattenreich zurück.
Danach überredet Pat den Shade, Todd und Jennie künftig als Mentor im Umgang mit den Schatten beizustehen. Jennie will zudem nach New York, um Sandy Hawkins – dem Neffen des Sandman Wesley Dodds – bei dessen prophetischen Albträumen zu helfen. Mister Bones erwägt, aus Helix ein eigenes Team zu formen. Zum Schluss wird klar, dass nicht Helix Blue Valley überwacht hat: In der Kanalisation schlägt eine vermummte Gestalt wütend auf einen Monitor ein.
Auf der Suche nach dem Mörder des Gamblers stoßen Mike und Jakeem im Wald auf eine monströse, albinoartige Kreatur und geraten in Cindys Fallen. Cindy offenbart, dass sie das Wesen jagt, um ihre Unschuld am Tod des Gamblers zu beweisen. Zurück im Diner erkennen Pat und Sylvester das Geschöpf als den Ultra-Humanite.
Der Ultra-Humanite ist ein wahnsinniger Wissenschaftler, der seinen Verstand mithilfe von Dragon King in einen Frankenstein-Körper verpflanzte und einst zu den gefährlichsten Gegnern der ursprünglichen JSA zählte. Courtney folgert, dass sie gegen ihn jede verfügbare Kraft brauchen – auch die der Mahkents und der Crocks. Der gemeinsame Feind könnte die zerstrittenen Lager endlich einen.
Während Lily versucht, sich an Barbara zu rächen, rettet Paula diese im letzten Moment mit einem Warnschuss und bringt ihr anschließend Selbstverteidigung bei. Crusher und Paula suchen die trauernden Mahkents auf und können Sofus und Lily als einstige Freunde Jordans offenbar davon abbringen, ihren Rachefeldzug fortzusetzen.
Beth sorgt sich um Rick, den die manipulierte Sanduhr zunehmend aggressiv macht. Courtney stellt sich Cameron, der die Wahrheit über den Tod seines Vaters Jordan erfahren will. Um ihren Stiefbruder Mike zu schützen, der Jordan versehentlich überfahren hat, behauptet sie, ihn selbst getötet zu haben – woraufhin Cameron ihr erklärt, er wolle sie nie wiedersehen.
In der Schlussszene werden Crusher und Paula über eine Spur ausgelegter Flyer in die Kanalisation gelockt. Dort entpuppt sich der totgeglaubte Icicle – Jordan Mahkent – als der Beobachter, der Blue Valley die ganze Zeit überwacht hat. Er friert die beiden Crocks ein und tötet sie.
Ein Rückblick auf das Staffel-1-Finale zeigt, wie sich Icicles zerschlagene Eiskörper wieder sammeln und Jordan Mahkent zu neuem Leben erwecken. In der Gegenwart hat er sich in einem Versteck unter einem Fitnessstudio langsam regeneriert, seine Hand ist noch nicht vollständig verheilt.
Bei einem Treffen der Justice Society berät Courtney Whitmore, wie der Ultra-Humanite zu stoppen ist, und wirbt für ein Bündnis von Helden und Schurken. Artemis Crock platzt auf der Suche nach ihren Eltern herein. In den Tunneln unter Blue Valley finden Beth und die anderen menschliche Überreste und die zerbrochene Sportsmaster-Maske - die Crocks sind tot, und Artemis bricht zusammen.
Jordan kehrt zu seiner Familie zurück; Lily und Sofus sind überglücklich, sein Sohn Cameron bleibt zurückhaltend. Jordan behauptet, ein gewandelter Mann zu sein, der nur noch Frieden wolle, und gibt sich sogar Mike gegenüber versöhnlich, der ihn einst überfahren hatte.
Im American Dream stellt Barbara ihn zur Rede; Jordan gesteht, die Crocks getötet zu haben, nennt es aber Notwehr und bietet Hilfe gegen den Ultra-Humaniten an. Sylvester will Icicle aus Rache eigenhändig töten und verlangt von Courtney den Stab. Mike und Jakeem versuchen vergeblich, Jordan per Wunsch die Kräfte zu nehmen - Thunderbolt kann es nicht, weil es ihn töten würde; Cindy schließt sich den beiden an.
Cameron wirbt bei Courtney um einen Neuanfang und küsst sie, doch sie bleibt misstrauisch. Am Ende tritt Jordan im Wald dem Ultra-Humaniten gegenüber und erklärt, es sei nun so weit - ein Hinweis darauf, dass er mit dem Monster gemeinsame Sache macht.
In einer Rückblende gewinnt die Schauspielerin Dolores Winters einen Preis und tötet zu Hause einen Verehrer mit der Trophäe. Dr. Ito taucht auf; Dolores erklärt, die JSA sei ihr wieder auf der Spur und sie brauche einen neuen Körper. Als Vorschlag zeigt sie ihm einen Comic mit einem weißen Riesenaffen – ein Wesen, das Gegner wie die JSA mühelos ausschalten könnte.
In der Gegenwart setzt der Sanduhr-Kristall Rick immer stärker zu: Seine Kräfte wachsen, doch er verliert die Kontrolle. Als er verzweifelt um Hilfe bittet, wird Courtney stutzig – Sylvester hatte Rick geraten, den Limiter zu entfernen, obwohl Starman um dessen Gefahren gewusst haben musste. Warum sollte er ihm das raten?
Cindy führt Mike und Jakeem in die Tunnel ihres Vaters; mithilfe von Thunderbolt gelangen sie zu einem von Dragon Kings verborgenen Laboren. Dort finden sie Dragon Kings Leichnam mit geöffnetem Schädel – das Gehirn fehlt. Ein weißer Affe erscheint, nennt Cindy „Tochter“ und entpuppt sich als Dr. Ito. Bleibt die Frage: Wo steckt dann der Ultra-Humanite?
Sylvester besteht darauf, Icicle im Alleingang zu stellen, und stößt Pat brüsk vor den Kopf, indem er ihn als bloßen Sidekick verhöhnt. Courtney, die alles mit angehört hat, stellt sich vor ihn: Nicht Starman, sondern Pat sei ihr wahrer Held und der Vater, für den sie dankbar sei. Sylvester ruft daraufhin den Kosmischen Stab zu sich, der nicht zu Courtney zurückkehrt, und erklärt sie für seiner nicht würdig.
Am Anwesen der Mahkents stellt Pat den vermeintlichen Sylvester, der ihn mit dem Stab niederschlägt und in ein Grab zu schaufeln beginnt. Dabei offenbart sich der Schock: Der Kosmische Stab hat zwar Sylvesters Körper konserviert, doch in ihm steckt das Gehirn des irren Wissenschaftlers Ultra-Humanite. Er schildert, wie er sich als Sylvester und Starman ausgab, sich mit Icicle und Dr. Ito verbündete und die übrigen JSA-Mitglieder ausschaltete – und lässt Pat lebendig begraben zurück.
Eine Rückblende enthüllt das zentrale Geheimnis der Staffel: Der Voyeur – Jordan Mahkent alias Icicle – und Dragon King haben Sylvester Pemberton ausgegraben und aus der Stasis erweckt. Als Sylvester sich weigert, Jordans öffentliches Sprachrohr zu werden, lässt Dragon King das Gehirn des Ultra-Humanite in Sylvesters Körper verpflanzen. Der „Sylvester“, der die JSA über Wochen mit falschen Ratschlägen manipulierte, war also die ganze Zeit der Ultra-Humanite.
In der Gegenwart durchschaut die JSA, dass „Sylvester“ sie gezielt entzweite und Courtney den Kosmostab abnahm. Cameron lockt Courtney mit dem Hinweis, Starman warte am Schrottplatz. Dort behauptet „Sylvester“, der Ultra-Humanite habe Pat getötet – bis Pat mit dem reparierten S.T.R.I.P.E. auftaucht und offenbart, dass „Sylvester“ in Wahrheit der Ultra-Humanite ist.
Der große Kampf bricht los: Cindy, Jakeem und Mike stellen sich Dragon King, Pat nimmt es mit dem Ultra-Humanite auf, Courtney und Rick kämpfen gegen Icicle und den zwischen den Fronten stehenden Cameron. Beth und Sofus weigern sich, gegeneinander anzutreten; Lily wird von einem herabstürzenden Auto erschlagen. Jakeem findet endlich den Mut zu einem Herzenswunsch und verwandelt Dragon King in ein Plüschtier, was Cindy das Leben rettet.
Als Icicle Courtney töten will, rettet Barbara sie mit einer Armbrust, und Cameron durchschaut endlich den Verrat seines Vaters. Barbara erinnert Courtney daran, dass der Kosmostab nur deshalb dem Fremden gehorchte, weil sie an sich selbst zweifelte. Mit den Worten, er sei nicht würdig – sie aber schon –, entreißt Courtney dem Ultra-Humanite den Stab. Cameron bezwingt seinen Vater im Eis-Duell, und Pat erschlägt den Ultra-Humanite mit einem Stein.
In den Nachwehen nimmt der schuldbeladene Cameron seinen verletzten Großvater und verschwindet. Der Ultra-Humanite ist hirntot, doch Sylvesters echtes Gehirn existiert weiter in einem Versteck von Dragon King – Pat behält den Körper vorsorglich an lebenserhaltenden Geräten. Es folgen Versöhnungen (Rick mit Beths Familie, Mike mit seiner leiblichen Mutter, Courtney mit der Tochter des Gamblers), und Cameron kehrt zu Courtney zurück. Drei Monate später tötet Artemis den untergetauchten Jordan in Kopenhagen; zehn Jahre später führt Shade durch ein JSA-Museum, bis der Flash die Society zu neuen Abenteuern ruft: „Never the End.“