Ark-1 erreicht das Wrack von Ark-3, um dringend benötigte Bauteile für die eigenen Reparaturen zu bergen – doch an Bord ist bereits jemand vor ihnen. William Trust liefert einen ersten Hinweis: Das an Ark-3 angedockte Shuttle gehört der Eastern Federation, jener Macht, gegen die ein großer Krieg geführt wurde und die vor allem für Kimi eine sehr persönliche Bedeutung hat.
Weil die Kamerabilder durch alte Schäden nur noch als Einzelaufnahmen in Intervallen ankommen, sieht es zunächst so aus, als sei Ark-3 von einer ganzen Armee besetzt. Beim Betreten des Schiffs zeigt sich das Grauen: Jemand hat die Leichen der Ark-3-Besatzung überall im Schiff aufgestellt, sodass sie lebendig wirken – das titelgebende „Museum des Todes“. Garnet stößt schließlich auf einen tatsächlich Lebenden, der zu fliehen versucht und gestellt wird.
Der Mann entpuppt sich als Evas Bruder. Er hatte sich der Eastern Federation angeschlossen, um seine Schwester zu finden, von der er wusste, dass sie auf einer der ersten drei Archen war. Die Föderation ließ ihn jedoch auf Ark-3 zurück, wo die lange Isolation ihn in den Wahnsinn getrieben hat. Ark-1 gelingt es, die Frontsektion von Ark-3 abzutrennen und am eigenen Schiff zu installieren – doch Evas Bruder überlebt nicht: Bei der Übertragung versucht er, zurück nach Ark-3 zu gelangen, und kommt dabei ums Leben.
Zuvor bringt die Crew ihn noch an Bord von Ark-1, wo er behandelt werden soll. Er ist jedoch vollständig von der Realität abgeschnitten, will nur zurück zu seiner „Frau“ und seinen „Freunden“ und droht, Evas Vergangenheit zu enthüllen. Das Gespräch führen die Geschwister auf Serbisch, das nur Jelena versteht; sie behält das Gehörte für sich. Immer deutlicher wird, dass Eva einst mit der Eastern Federation verbunden war – am Ende der Episode löscht sie heimlich ihren eigenen Eintrag aus dem System, der sechs Vorstrafen auswies.
Nebenbei kehrt der genesene Angus zu seinem Garten zurück, wird dort aber von einer Ark-15-Kollegin nicht als dessen Erbauer erkannt und für sein Bewässerungssystem sogar herablassend behandelt. Und Kelly erfährt von Trust, dass Maddox ihren Vater vergiftet hat – eine Nachricht, die sie traurig, aber angesichts ihrer Mutter nicht überrascht aufnimmt.