Milos und die Klone der zweiten Generation schleusen ein Betäubungsmittel aus zermahlenen Pillen in das Lüftungssystem der Ark-1 und legen so nahezu die gesamte Besatzung schlafend. Ihr Ziel: sich mit allen Mitteln die Freiheit zu erkämpfen und eine eigene Klon-Kolonie auf einem eigenen Planeten zu gründen.
Captain Garnet, selbst eine Klonin, hält dem Betäubungsmittel länger stand als die übrige Crew. Bevor auch sie das Bewusstsein verliert, findet sie die Fernsteuerung für Kellys Augmentierungen und schaltet sämtliche Fähigkeiten frei.
Mit voller Kraft kämpft sich Kelly zur Krankenstation durch und weckt einen Kern der Besatzung wieder auf. Gemeinsam mit den Ärzten Kabir und Marsh entsteht der Plan, ein Gegenmittel als Aerosol herzustellen, um das gesamte Schiff wieder zu wecken.
Am Ende werden die Meuterer überwältigt und die Kontrolle über die Ark-1 kehrt zur rechtmäßigen Besatzung zurück.