Das Staffelfinale führt die Enterprise an den Rand des Föderationsraums, wo die Gorn nach ihrem ersten Auftauchen in Staffel 1 endgültig zur großen Bedrohung werden. Christine Chapel unterstützt Captain Marie Batel und die USS Cayuga bei Impfungen für die junge Kolonie Parnassus Beta – einen Vorposten knapp außerhalb des Föderationsgebiets. Mitten in die Routine schlägt ein Gorn-Angriff ein, der die Kolonie überrollt und den Kontakt abreißen lässt.
Als die Enterprise eintrifft, findet Captain Pike eine verwüstete Welt vor. Die Gorn melden sich bei Starfleet Command und beanspruchen das Gebiet als ihr Hoheitsgebiet; Starfleet weist Pike daraufhin an, sich unsichtbar zu halten und nicht einzugreifen. Erschwerend kommt hinzu, dass die Gorn ein Dämpfungsfeld errichtet haben, das jeden Transportervorgang von der Oberfläche blockiert – die Überlebenden lassen sich nicht einfach hochbeamen.
Pike setzt sich über den Befehl hinweg und schickt ein Außenteam auf den Planeten, um nach Überlebenden zu suchen. Unter den Vermissten ist auch Batel, die beim Angriff auf die Cayuga verschollen ist. Auf der Oberfläche stoßen La'an Noonien-Singh, Joseph M'Benga und Erica Ortegas auf einen jüngeren Ingenieur, der die Serie mit einer Ikone der Original-Serie verbindet: den frisch eingeführten Montgomery „Scotty“ Scott, der als findiger Techniker sofort zum Schlüssel gegen die Gorn-Technologie wird.
Parallel spitzt sich Batels Lage zu. Chapel bringt die schwer verletzte Captain in die Krankenstation und legt sie in ein Stasefeld, um die von den Gorn eingepflanzten Eier zu entfernen, bevor sie schlüpfen. Die Infektion breitet sich jedoch sichtbar über ihren Körper aus, und ein sicheres Gegenmittel ist nicht in Reichweite.
Zum Abschluss treffen Gorn-Verstärkungen ein und eröffnen das Feuer auf die Enterprise. Spock registriert, wie die Gorn die verbliebenen Kolonisten von der Oberfläche wegbeamen – zusammen mit La'an, M'Benga und Ortegas. Das Finale endet mit einem harten Cliffhanger: Ein Großteil der Kolonie und mehrere Schlüsselfiguren der Crew befinden sich in Gorn-Gewalt, während Pike vor einer scheinbar aussichtslosen Lage steht.
