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Auf der Suche nach der entführten Prinzessin Leia Organa reist Obi-Wan Kenobi zum zwielichtigen Planeten Daiyu, wo alle Signale blockiert sind und er die Spur des Entführers Vect Nokru verliert. In den Gassen trifft er auf den Kleinganoven Haja Estree, der sich als hilfsbereiter Jedi ausgibt und verängstigten Familien gegen Bezahlung zur Flucht verhilft. Kenobi entlarvt ihn als Betrüger, der mit Magneten und Fernbedienungen Machtkräfte vortäuscht, und zwingt ihn, bei der Suche nach dem Mädchen zu helfen.
Haja führt Kenobi zu den Kanälen unter der Stadt. Getarnt dringt Kenobi in ein Drogenlabor ein und findet die Zelle, in der er Leia vermutet — doch dort steht nur ein Lockvogel-Droide. Nokru und seine Schergen überwältigen ihn, unterschätzen ihn aber: Kenobi zerschlägt eine Phiole roten Spice, blendet die Entführer und sperrt sie in ihre eigene Zelle. Anschließend befreit er die zunächst misstrauische Leia und führt sie zurück an die Oberfläche.
Unterdessen stellt der Großinquisitor die Dritte Schwester Reva zur Rede, weil sie eigenmächtig die Tochter eines Senators entführen ließ, um Kenobi aus dem Versteck zu locken. Der Großinquisitor enthebt Reva ihrer Aufgaben und will Kenobi selbst stellen. Trotzig setzt Reva ein Kopfgeld auf Kenobi aus, woraufhin Kopfgeldjäger und Kriminelle die ganze Stadt nach ihm absuchen.
Als Leia auf dem Hologramm eines Kopfgeldjägers Kenobis Gesicht erkennt, verliert sie das Vertrauen und flieht über die Dächer Daiyus. Bei dem Versuch, auf ein anderes Gebäude zu springen, stürzt sie ab; Kenobi rettet sie mit der Macht und gewinnt so ihr Vertrauen zurück. Am abgeriegelten Raumhafen taucht erneut Haja auf, erschießt einen Droiden-Kopfgeldjäger und weist die beiden auf einen automatisierten Frachttransport nach Mapuzo hin.
Im Frachthafen stellt Reva Kenobi und offenbart ihm, dass Anakin Skywalker als Darth Vader noch lebt und nach ihm sucht — eine Nachricht, die Kenobi zutiefst erschüttert. Bevor Reva ihn ausliefern kann, wird sie vom Großinquisitor unterbrochen; sie ersticht ihren Vorgesetzten und ermöglicht Kenobi und Leia so unbeabsichtigt die Flucht mit dem Frachtshuttle. Während der Fahrt spürt Kenobi eine Erschütterung in der Macht. Andernorts erwacht Darth Vader in einem Bacta-Tank.
Auf Mustafar erhebt sich Darth Vader aus seinem Bacta-Tank und lässt sich den Anzug anlegen. Die Dritte Schwester Reva meldet ihm, dass Obi-Wan Kenobi noch lebt. Vader stellt ihr die Position des Großinquisitors in Aussicht, sollte sie seinen einstigen Meister aufspüren – droht ihr aber unmissverständlich, dass sie ein Scheitern nicht überleben werde.
Obi-Wan und Prinzessin Leia landen mit einem Frachtshuttle auf dem vom Imperium besetzten, durch Bergbau verwüsteten Planeten Mapuzo. Kenobi gibt Leia als seine Tochter aus und ringt zugleich mit der Erkenntnis, dass sein ehemaliger Schüler Anakin Skywalker noch lebt – kurz erscheint ihm dessen Gestalt am Horizont. Am vereinbarten Treffpunkt, den der Schwindler Haja Estree arrangiert hatte, ist jedoch niemand.
Leia hält ein Fahrzeug an; der imperialtreue Fahrer Freck nimmt die beiden mit. An einer Stormtrooper-Kontrolle nennt Obi-Wan versehentlich Leias echten Namen, kann den Fehler aber überspielen. Unterwegs fragt Leia nach ihrer Herkunft, woraufhin Kenobi vom Jedi-Orden als seiner Ersatzfamilie erzählt. An einem imperialen Checkpoint verrät Freck sie schließlich: Ein Sonden-Droide scannt Obi-Wan, der ihn zerstört und die Wachen ausschaltet. Die imperiale Offizierin Tala Durith – in Wahrheit Hajas Kontakt – tötet die übrigen Soldaten und verhilft den beiden zur Flucht.
Tala bringt sie in ihre Werkstatt in einer nahen Siedlung und offenbart, dass sie einem Untergrundnetzwerk angehört, das Jedi und Machtsensitive in Sicherheit bringt – sie arbeitete einst sogar mit Quinlan Vos. Als die Gruppe nachts zum Raumhafen aufbricht, spürt Obi-Wan eine Erschütterung der Macht: Darth Vader, drei Inquisitoren und Stormtrooper sind eingetroffen. Vader schreitet durch die Straßen und tötet wahllos Zivilisten, um Kenobi hervorzulocken. Obi-Wan schickt Tala und Leia nach Alderaan voraus und flieht in einen nahen Steinbruch, wo Vader ihn verfolgt.
Im Steinbruch stellt sich Obi-Wan schließlich und fragt Vader, was aus ihm geworden sei – dieser entgegnet, er sei, was Obi-Wan aus ihm gemacht habe. Es kommt zu einem kurzen, heftigen Duell, in dem Vader den unterlegenen Kenobi zurückdrängt. Er entzündet mit seinem Lichtschwert brennbares Gestein und zwingt Obi-Wan mit der Macht in die Flammen, mit den Worten, dessen Schmerz habe gerade erst begonnen. Erst als die von Leia zurückgeschickte Tala das Feuer mit einem Blasterschuss neu entfacht und Vader so abschneidet, kann der Droide NED-B den schwer verbrannten Obi-Wan in Sicherheit bringen.
Während Kenobi entkommt, läuft Leia am Raumhafen direkt der Dritten Schwester in die Arme, die den Piloten bereits getötet hat. Reva versucht, Leias Vertrauen zu gewinnen, doch das Mädchen wittert die Gefahr und ergreift die Flucht.
Nach der knappen Flucht vor Darth Vader erwacht Obi-Wan Kenobi an Bord des Schiffs von Tala Durith, die ihn gemeinsam mit ihrem Droiden NED-B versorgt. In einem Bacta-Tank suchen ihn Bilder seines Duells mit Vader heim, sodass er panisch aus dem Tank steigt. Tala verrät ihm, dass sie sich auf dem Planeten Jabiim befinden – und Kenobi fragt sofort nach dem Verbleib der entführten Leia.
In der Festung Inquisitorius auf dem Ozeanmond Nur wird die trotzige Leia von der Dritten Schwester Reva verhört, die ihr das geheime Fluchtnetzwerk „Hidden Path“ entlocken will. Auf Jabiim überzeugt Kenobi den zunächst abweisenden Kawlan Roken, bei der Rettung zu helfen. Der Plan: Tala schleust sich mit ihrer Offiziersfreigabe in die Festung ein, während Kenobi durchs Meer zu einem überbrückten Hafeneingang taucht und die Anlage betritt.
Im Inneren stößt Kenobi auf eine verschlossene Kammer voller konservierter toter Jedi, darunter Meister Tera Sinube und ein Youngling. Als Reva Leia zur Folter anschnallt, spürt Kenobi ihre Gefahr, schaltet das Licht im Verhörraum aus, überwältigt die Wachen und befreit Leia. Auf der Flucht kämpfen sich die beiden durch die Korridore; ein Tunnel wird geflutet, und Tala fliegt auf, als Reva ihre Tarnung durchschaut.
Bevor Reva die Gruppe im Haupthangar hinrichten lassen kann, greifen zwei T-47-Gleiter die imperialen Truppen an. Sully evakuiert Tala, Kenobi und Leia, während Wade sich opfert und von Reva mit einem geschleuderten Sprengsatz getötet wird. An Bord des Rettungsschiffs trauert Sully um ihren Kameraden.
Später würgt ein erzürnter Darth Vader die Dritte Schwester für ihr wiederholtes Versagen, verschont sie jedoch, als sie enthüllt, einen Peilsender an der Gruppe angebracht zu haben. Zum Schluss zeigt sich, wo der Tracker steckt: in Leias Begleitdroiden L0-LA59, genannt Lola, dessen Auge rot aufleuchtet.
In Rückblenden auf die Zeit vor „Angriff der Klonkrieger“ trainiert Obi-Wan Kenobi seinen Padawan Anakin Skywalker im Lichtschwertkampf und warnt ihn davor, sich vom Wunsch nach dem Sieg blenden zu lassen. In der Gegenwart hat das Imperium die Spur Kenobis nach Jabiim verfolgt: An Bord seines Sternzerstörers befördert Darth Vader die Dritte Schwester Reva zur Großinquisitorin und lässt Kurs auf den Planeten nehmen.
Auf Jabiim erreicht Kenobi mit Leia, Tala Durith, Kawlan Roken und weiteren Flüchtlingen den Stützpunkt des Path, eines Netzwerks, das Verfolgte des Imperiums in Sicherheit bringt. Die reprogrammierte Droidin Lola versiegelt das Hangardach, sodass die Gruppe zunächst gefangen ist. Kenobi organisiert die Verteidigung und schickt Leia durch die Lüftungsschächte, um das Dach wieder zu öffnen.
Um Zeit zu gewinnen, verhandelt Kenobi mit Reva und erkennt, dass sie Vaders wahre Identität kennt: Als Jüngling überlebte sie den Angriff auf den Jedi-Tempel, den Anakin Skywalker in der Nacht der Order 66 anführte. Reva will Vaders Vertrauen nur gewinnen, um sich an ihm zu rächen. Kenobi bietet ihr ein Bündnis an, doch sie weist ihn ab und durchbricht mit ihrem Lichtschwert das Tor der Basis.
Beim Sturm auf den Stützpunkt opfert sich Tala mit einem Sprengsatz, um den imperialen Vormarsch aufzuhalten. Kenobi ergibt sich, um Vader in die Falle zu locken, und überredet Reva, den Sith-Lord zu töten, sobald sie ihn ihm übergibt. Währenddessen befreit Leia die Droidin Lola vom imperialen Steuerbolzen und öffnet das Hangardach, sodass die Flüchtenden an Bord gehen können.
Reva greift Vader an, wird jedoch nach kurzem Duell überwältigt und niedergestochen. Der totgeglaubte Großinquisitor tritt hervor und bestätigt seinen Rang; beide lassen Reva schwer verwundet zurück. An Bord von Rokens Schiff bemerkt Kenobi, dass sein Holoprojektor fehlt – Reva fängt Bail Organas Nachricht ab und erfährt, dass Skywalker einen Sohn auf Tatooine hat, wo der junge Luke ahnungslos schläft.
Reva trifft auf Tatooine ein, um Luke Skywalker aufzuspüren, während Darth Vader und das Imperium das Fluchtschiff des Path-Netzwerks verfolgen. Damit seine Freunde und Prinzessin Leia entkommen können, löst sich Obi-Wan Kenobi von der Gruppe und lockt Vader auf einen nahen, kargen Mond, um ihn zum Duell zu stellen.
Im Zweikampf hält Kenobi zunächst stand, wird aber überwältigt und unter herabstürzendem Gestein begraben. Während er die Felsen mit letzter Kraft der Macht zurückhält, findet er über Erinnerungen an Luke und Leia zu seiner vollen Verbindung zur Macht zurück, befreit sich und überwältigt Vader. Er beschädigt dessen Rüstung und schlägt ein Stück der Maske ab, das Anakin Skywalkers vernarbtes Gesicht freilegt. Kenobi entschuldigt sich, doch Vader entgegnet, er habe Anakin selbst getötet; erschüttert erkennt Kenobi, dass sein einstiger Freund verloren ist, und geht.
Am Anwesen der Lars stellt sich Reva Owen und Beru, überwältigt beide und verfolgt Luke in die Wüste. Als sie sich an Anakins Massaker an den Jedi-Schülern erinnert und ihr jüngeres Ich in Luke wiedererkennt, bringt sie den Jungen zu seiner Familie zurück. Kenobi versichert ihr, dass sie durch ihre Gnade weder gescheitert noch der dunklen Seite verfallen ist.
Auf Mustafar gibt ein geheilter Vader die Suche nach Kenobi auf, nachdem Imperator Palpatine seine Loyalität in Zweifel zieht. Auf Alderaan findet Leia neuen Halt in ihrer Rolle als Prinzessin, und Kenobi sagt den Organas seine Hilfe zu. Zurück auf Tatooine söhnt er sich mit Owen aus, darf endlich Luke begrüßen und spricht schließlich mit dem Machtgeist seines einstigen Meisters Qui-Gon Jinn.
