Barry Allen findet sich im Jahr 2031 wieder, in dem sein Erzfeind Eobard Thawne seinen Platz eingenommen hat: Thawne ist der Flash und mit Iris West verlobt, während Barry als Reverse-Flash gilt. Barry muss gegen seine eigenen Verbündeten kämpfen und erfährt, dass Ray, Nate, Sara und Cisco in dieser Zeitlinie gestorben sind.
Thawne erklärt, wie er diese Realität geschaffen hat: Mit einer umgekehrten Flashpoint-Manipulation tötete er Joe, reiste zurück ins Jahr 2013, ließ sich selbst vom Blitz treffen, führte Team Flash an und machte Barry zum Schurken — schließlich tötete er Barry als Kind. Um Mitternacht soll sich die Zeitlinie endgültig verfestigen.
Barry gewinnt den in dieser Zeitlinie noch lebenden Damien Darhk als Verbündeten, indem er an dessen Opfer und dessen Tochter Nora in der ursprünglichen Realität appelliert. Gemeinsam ersinnen sie einen Plan: Barry muss mit enormer Geschwindigkeit um die Erde laufen und durch ein Zeitportal stoßen — was jedoch das im Titel angekündigte Armageddon auslöst, genau wie Despero es prophezeit hatte.
Barry sucht Iris auf und gesteht ihr seine Liebe. Als Thawne sie drängt, die Geschwindigkeit raubende Waffe gegen Barry einzusetzen, richtet sie diese stattdessen gegen Thawne und lässt Barry ziehen; auch Iris bekennt ihre Liebe. Barry kehrt nach 2021 zurück und löscht die Zeitlinie, in der Despero das Team getötet hätte. Er zeigt Despero die gesicherte Zukunft, STAR Labs ist wieder heil und Joe lebt. Doch auch Eobard Thawne ist zurück in der Gegenwart — im Reverse-Flash-Anzug und entschlossen, den Lauf der Dinge erneut zu ändern.